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利用无菌植物和可培养细菌体系研究根系微生物组功能
Utilization of Axenic Plants and Cultivated Bacteria for Studying Root Microbiota’s Function
Authors:  徐浩然张婧赢, 曲宝原, 刘永鑫, 白洋 and date: 04/27/2021, view: 3683, Q&A: 0
因此，研究根系微生物组与植物间的关系有着重要价值。生态学方法通常直接研究植物与根系微生物的整体，这对于揭示自然环境中微生物组的组成结构等至关重要。 本文提供了使用无菌植物和可培养细菌体系研究根系微生物功能的实验思路及方法，此方法可以用于研究植物和微生物组间的相互作用。 研究背景以群落形式聚集于植物根内或根表的根系微生物组 (Microbiota)
水稻根系微生物组研究中的样本种植、取样和16S rRNA 基因扩增子文库制备方法
Planting, Sample Collection and Library Preparation of 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing for Rice Root Microbiomes
Authors:  徐浩然张婧赢, 郭晓璇, 曲宝原, 刘永鑫, 白洋 and date: 04/27/2021, view: 4596, Q&A: 1
根系样本的收取 (图 2)。为了获得和水稻根系紧密联系的微生物数据，需要获得尽可能干净的根系样本。 失败经验 控制环境微生物污染。微生物在环境中普遍存在的特性导致实验过程中样本容易受到环境微生物的污染。 为防止PCR过程中引物偏好性引入差异，PCR过程进行3组平行扩增并混合；为防止扩增效率不同引入差异，同类样本的PCR产物浓度、电泳条带亮度应在一定范围内保持一致，避免出现2倍以上的差异；为防止切胶回收过程引入差异 使用无菌滤纸吸干根系
高通量分离培养和鉴定植物根系细菌
High-throughput Cultivation and Identification of Bacteria from the Plant Root Microbiota
Authors:  张婧赢刘永鑫, 郭晓璇, 秦媛, 白洋 and date: 06/01/2021, view: 7578, Q&A: 3
该领域正在进入快速发展期，下一阶段必然着重研究根系微生物组在植物中的功能，并逐渐揭示植物与根系微生物组互作过程的分子机制。目前，阻碍根系微生物功能及植物与微生物互作研究的关键因素是根系微生物资源。 植物根系微生物组的研究主要以描述性工作为主，利用高通量扩增子和宏基因组测序技术，描述自然土壤中生长的各种植物根系