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群落构建过程的定量指标——扩散-生态位连续体指数
Dispersal-niche Continuum Index: A Quantitative Metric of Community Assembly Processes
Authors:  孟凡凡Annika Vilmi, Corentin Gibert, 王建军 and date: 04/29/2021, view: 8760, Q&A: 0
DNCI指数用于定量β层次的群落构建过程，即群落组间而非群落组内，这与以往的群落构建定量方法迥异，从而突破了传统意义上α层次的群落构建认知，发展了一个崭新视角定量评估群落构建特征(如图2)。图2. 同时，现有的定量方法仅关注α层次的群落构建过程，即群落组内不同生态过程的相对贡献大小，而忽略了β层次(群落组间)的群落构建
微生物群落构建过程的空间可视化方法
Spatial Visualization of Microbial Community Assembly Processes
Authors:  闫慧贞王凯, 张德民 and date: 02/10/2021, view: 4623, Q&A: 0
，即群落构建过程。 成对站位群落构建过程属性表在ArcGIS中将群落构建过程属性表与站位经纬度表链接，并根据各类过程调整成对站位连线颜色4.1将群落构建过程属性表链接至站位经纬度表 右击步骤2.3中经XY To Line 将成对采样站位之间的微生物群落构建过程映射在地图上，即可反映出研究区域中各种生态过程的地理空间分布格局。 ，实际操作中可根据研究区域针对性选用地图图层) 结合，即可生成微生物群落
土壤动物肠道微生物样本采集及分析方法
Methods for Collection and Analysis of Gut Microbiota in Soil Animals
Authors:  郝操龚鑫, 朱冬, 吴东辉 and date: 01/05/2023, view: 1933, Q&A: 0
... 2.3微生物群落构建过程分析 微生物群落的多种生态过程，同质性选择和异致性选择 (确定性过程) 以及扩散限制和同质性扩散 (随机性过程) 如何驱动土壤动物肠道微生物群落构建已成为土壤动物肠道微生物领域研究的前沿 目前，土壤动物肠道微生物多样性和群落组成及其驱动机制，群落内物种共存机制和群落构建的理论研究是土壤动物肠道微生物多样性领域研究的前沿 (Berg et al., 2016; Gong et al., 2018 以此，
谱系分析在群落生态学中的应用
The Application of Phylogenetic Methods in Community Ecology
Authors:  赵郁豪曾頔, 斯幸峰 and date: 10/28/2021, view: 13159, Q&A: 0
研究背景群落是如何构建的是群落生态学的研究核心。 Webb et al. (2002) 利用群落系统发育结构建立了一个启发式框架，用于揭示群落构建的主要驱动力。 近20年，随着分子生物学技术和系统发育研究方法的发展与应用，生态学家渐渐将系统发育关系与群落构建结合在一起，从进化的角度探究群落构建的过程 (Webb, 2000; Webb et al., 2002; 这个框架假设性状与环境的匹配 (即环
原核微生物群落随机性和确定性装配过程的计算方法
Calculation Method for Stochastic and Deterministic Assembly Processes of Prokaryotic Communities
Authors:  赵维王兴彪, 侍浏洋, 朱婉瑜, 马磊, 王敬敬, 徐松, 杨榕, 张小霞, 韩一凡, 黄志勇 and date: 03/25/2021, view: 8591, Q&A: 0
在解释原核微生物群落构建机制中，零模型是群落数据或者进化树数据进行随机化的方式。 关于使用零模型 (null model) 方法解释原核微生物群落构建：零模型用于验证基于自然实验的生态学假说，它以计算机技术为基础，从已经获得的实验数据出发，构建受控的生态随机模型，最后用标准的统计检验方法验证理论假说 对于原核微生物群落而言，环境中的微生物种类只能尽最大的可能通过高通量、高分辨率的分析方法获得，但是仍然无法完全获知其中的全部微生物组成，因此，零模型的构建
微生物生物地理学研究方法
Research Methods of Microbial Biogeography
Authors:  彭子恒焦硕, 韦革宏 and date: 06/01/2021, view: 4649, Q&A: 1
... 生态群落构建过程分析结果 确定性过程 (50%) 和随机性过程 (50%) 共同解释了细菌群落的分布。 细菌群落β多样性变化分析结果 细菌群落β多样性随土壤CEC呈现出明显的变化。八、 群落生态过程分析介绍：生态群落构建过程通常分为基于生态位的确定性过程和基于中性模型的随机性过程。 距离衰减关系分析结果 河西走廊森林土壤细菌群落呈现出显著的距离衰减关系。六、 细菌群落结构的影响因素分析介绍：探究微生物群落
利用种分布模型绘制微生物分布图谱
Illustrating Microbial Distribution Map Utilizing Species Distribution Modeling
Authors:  李云涛褚海燕 and date: 04/27/2021, view: 2921, Q&A: 1
... 此外，在进行种分布模型预测前，建议先分析微生物群落构建过程。如果随机性过程主导了微生物群落组装过程，那么通过该方法进行微生物地理分布预测的可靠性会降低。 种分布模型构建5.1合并步骤4中的所有栅格对象 predictors = stack (r1, r2...)5.2查看合并后每个土壤理化性状对应的名字 Names (predictors) 注：合并后， 交叉验证种分布模型的效力 注：在交叉验证时，首先将观测数据 (示例中为243个) 随机分为两部分，其中2/3 (162个) 用于广义线性模型构建
矿区先锋植物根内生促生菌的高效分离与群落稳定构建
The Efficient Isolation of Growth-Promoting Endophytic Bacteria from Pioneer Plants in Mining Areas and the Stable Construction of Microbial Communities
Authors:  高寒冰何晓, 贾沃, 郭朝晖, 徐锐 and date: 11/08/2024, view: 2124, Q&A: 0
合成菌群的构建则根据以上结果进行综合判断，按照菌OD600 = 0.5，体积比为1:1的结果来进行构建。 当根际微生物群落的PICRUSt2基因预测结果显示具有显著表达的与植物促生相关的功能基因（如ipdC、acrA、mbtH、nifH等）和与特定污染物抗性相关的基因（如aioA、arsA、czcD等）时， 选择互利共生的菌株构建合成菌群进行进一步实验。本方法用来探究挥发性物质对菌群的影响（图4）。图 4. 最后，基于所筛选出的功能菌株，构建低复杂性且高可控性的合成菌群，并通过植物促生实验验证其在矿区生态