通用单拷贝核基因的搜索结果

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利用基因组数据设计通用单拷贝核基因与超保守元件分子标记方法
Streamlining Universal Single-copy Orthologue and Ultraconserved Element Design Method from Whole Genome Sequencing
Authors:  丁银环杜诗雨, 张峰 and date: 07/30/2021, view: 5055, Q&A: 0
基因组数据设计通用单拷贝核基因与超保守元件分子标记流程图三、基因组注释重复序列屏蔽。基因组中的重复序列会导致BLAST的结果出现假阳性,增加基因结构预测的计算压力,甚至影响注释正确性。 本文提供了详细的利用基因组数据设计通用单拷贝核基因与超保守元件分子标记的分析流程,该方案的有效性已在弹尾纲的分子系统学研究中得以验证,详细内容请
基于二代全基因组测序的快速基因组组装技术流程
Technical Process of Rapid Genome Assembly Based on NGS Whole-genome Sequencing
Authors:  杜诗雨丁银环, 张峰 and date: 07/15/2021, view: 6681, Q&A: 1
数据分析本文使用Zhang normal;">et al. (2019) 中的数据,通过PLWS中script1_Genome_assembly1.sh成功地快速组装了基因组,并用于后续通用单拷贝核基因 仪器设备普通电脑 (最低4核8线程,16 G内存)软件本教程可以自行在服务器或个人电脑上安装好相关软件进行。相关软件的安装版本及使用说明如下。 实验步骤该流程主要指基于二代全基因组测序的原始数据进行快速基因组组装。可以
Cellular Retention Assay to Determine the Interaction Frequency of CD19-directed Chimeric Antigen Receptor (CAR) Engineered Cells against CD19+ Leukemic Cells
一种利用细胞滞留检测技术测定抗CD19的嵌合抗原受体T细胞对白血病细胞抑制效果的方法
Authors:  Marvin I. De los SantosSamuel D. Bernal and date: 09/05/2019, view: 3999, Q&A: 0
... CAR结构中单链抗体结合特异性的异常可能阻止这些癌细胞的成功根除。 当细胞内区域有利于t细胞介导的肿瘤杀伤时,car的单链抗体结构域在工程t细胞的“搜索和攻击”操作中起着至关重要的作用。 ... 脂质复合物和多聚体转染后细胞核中质粒dna拷贝的定量。j对照释放>135(2):166-174。Sommeregger,W.,Prewein,B.,Reinhart,D.
Maize Genome Assembly with PacBio Reads
利用PacBio Reads组装玉米基因组
Authors:  Ying HuMarcio F. R. Resende Jr. and date: 07/05/2022, view: 1142, Q&A: 0
... 长读长测序技术有助于准确分析高度丰富的重复序列,否则会挑战真核基因组中的序列比对和组装程序。 ... 质量评估使用基准通用单拷贝直系同源物 (BUSCO) v3.02 评估组装的基因组序列的基因组完整性。
有瓣蝇类野外采集与标本制作、保存、鉴定方法 及分子系统学研究
Collection, Preparation, Preservation, Identification and Molecular Phylogenetics of Calyptratae (Diptera: Schizophora)
Authors:  张东闫利平, 李心钰, 孙浩然, 徐雯恬 and date: 11/11/2021, view: 2334, Q&A: 0
... Orthograph进行单拷贝同源基因分配的参考数据库。 选取已完备测序和注释的参考物种基因组,使用OrthoFinder version 1.1.10 (Emms and Kelly, 2015) 识别出其共享的单拷贝同源基因,并构建单拷贝同源基因数据库,作为 得益于通用引物的设计,线粒体基因组一直被广泛应用于系统发育重建研究,如Zhang et al. (2016)、Y