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混合分子标记扩增子高通量测序方案
A Mixed Molecular Marker Amplicon Sequencing Scheme Based on High Throughput Sequencing Platform
Authors:  李佳璇张圆, 梁丹, 张鹏 and date: 01/25/2021, view: 5204, Q&A: 0
,实现混合分子标记扩增子的高通量测序,其工作流程图如图1所示。 六、 文库构建和高通量测序 (参考图1步骤5) 使用高通量文库构建试剂盒 (如: NEBNext Ultra DNA Library Prep Kit) 对割胶产物进行文库构建 (具体方法参阅产品说明书 混合PCR产物高通量测序方案的实验流程图 一、 对所选分子标记进行PCR扩增 在大规模扩增分子标记之前,建议开展一个预实验,随机挑选2-3个样本和5-10种分子标记分别进行PCR扩增,目的是确保PCR反应体
土壤线虫群落DNA提取、扩增及高通量测序
DNA Extraction, Amplification and High-throughput Sequencing of Soil Nematode Community
Authors:  杜晓芳梁文举, 李琪 and date: 06/17/2021, view: 6391, Q&A: 0
,为利用高通量测序技术开展土壤线虫群落研究提供了技术参考。 线虫高通量测序数据的处理可根据需求灵活分析,也可使用Usearch软件对原始测序序列进行质控,聚类,生成OTU表。 基于高通量测序不同提取方法线虫测序深度比较 注意事项针对不同的土壤选择合适的土壤线虫提取方法是提取线虫DNA的关键步骤,在保证线虫富集效率的同时还要保证线虫悬液样本的清晰,土壤线虫提取方法的选择可参考张晓珂等 7)提取的线虫DNA储存在-80 °C冰箱用于后续
基于高通量测序的全长DNA条形码获取方法
Methods for Obtaining Full-length DNA Barcodes Using High-throughput Sequencing
Authors:  杨琛涛周程冉, 刘山林, 周欣 and date: 08/25/2021, view: 5249, Q&A: 0
实验步骤本实验流程包含了三种高通量条形码获取的流程,三种方法的测序前实验环节方法一致 (对应步骤1至3),测序文库构建、测序及分析环节有差异。 ;利用高通量测序技术来分析复杂的环境样品 (如混合样品、环境DNA (eDNA)、无脊椎动物来源的DNA (iDNA) 等)。 高通量测序技术选择与测序得到PCR产物之后,可以根据选择的方法对测序平台进行选择,然后进行相应的标准文库的构建和测序。3.1HIF
基于高通量测序技术的丛枝菌根真菌多样性研究方法
High-throughput Sequencing-based Method for Characterizing Biodiversity of Arbuscular Mycorrhizal Fungi
Authors:  付伟武慧, 陈保冬 and date: 04/22/2021, view: 6443, Q&A: 0
PCR产物经纯化、混样 (等摩尔浓度)、建库后,使用Illumina MiSeq PE300进行双端测序测序深度建议大于10,000条reads。扩增与测序也可交由测序服务商进行。 只能使用PacBio三代测序平台,成本较高,数据分析要求较高。 传统的测序区域。此区域较长仅能使用454和PacBio,但区分度远不及Cf/Br。 扩增与测序 使用两步PCR法对目的片段进行扩增 (Egan et al., 2018; Lekberg et al., 2018)。 结合以上