16S rRNA基因高通量测序 (16S-seq)的搜索结果

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Cas-16S-seq：利用CRISPR/Cas9靶向消除16S-seq中高丰度植物序列的方法
Cas-16S-seq: Using CRISPR/Cas9 to Eliminate Abundant Plant Sequences in 16S-seq
Authors:  宋露洋谢卡斌 and date: 04/13/2021, view: 3041, Q&A: 0
是将CRISPR/Cas9系统与现有的16S rRNA基因高通量测序 (16S-seq)进行结合，利用CRISPR/Cas9靶向切割特定序列的能力，从而在16S rRNA基因扩增子文库构建过程中去除大量共扩增的宿主序列 本文以水稻16S rRNA基因为例，简要地介绍了Cas-16S-seq所需gRNA的设计流程 (图3)。图3. 本文以799F-1193R扩增
DNA稳定同位素示踪与宏基因组单菌草图组装联用技术
DNA-Stable Isotope Probing and Metagenomics Binning
Authors:  徐锐陶婉, 黄端仪, 苏平舟, 孙晓旭, 张苗苗, 孙蔚旻 and date: 04/12/2021, view: 4627, Q&A: 0
二、 16S rRNA扩增子测序结果图8. 标记样品的选择与高通量测序图8所示：重点选取每个离心样品的各峰尖层 (F10)、及左右两层 (F9+F11) 进行测序可减少测序成本。 使用Earth Microbiome Project推荐的引物对基因组DNA的16S rRNA片段进行高通量测序 (Illumina MiSeq PE250)；主要分析细菌群落组成；下机数据主要使用QII
土壤宏转录组学样本前处理与数据分析
Sample Pretreatment and Data Analysis of Soil Metatranscriptome
Authors:  张丽燕连政汉, 褚海燕 and date: 02/10/2021, view: 4887, Q&A: 4
... 图2.以酸性土样本为例的土壤微生物活性基因在KEGG level 2水平上的功能分类四、 土壤宏转录组研究的优点当与室内培养控制实验和高通量测序结合使用时，可以估算群落中特定微生物正在进行的积极的转录过程 原核生物的核糖体rRNA主要由23S、16S和5S rRNA组成。 ，16S rRNA 及 23S rRNA两条标志性条带清晰，说明该方法提取RNA得到了比较纯的RNA样品，经公司评价，满足建库要求。 将装有RNA样品的EP
使用QIIME 2 2025.4分析微生物组16S rDNA基因和ITS扩增子测序数据
Using QIIME 2 2025.4 to Analyze Microbiome 16S rDNA Gene and ITS Amplicon Sequencing Data
Authors:  杨海飞曾美尹, 高云云, 陈同, 刘永鑫 and date: 08/01/2025, view: 3082, Q&A: 1
在Linux系统下，以Miniconda3软件和Python3虚拟环境安装QIIME 2流程；然后下载16S rRNA基因数据库，建立物种分类器（视频2）。 本研究旨在提供一套基于 QIIME 2 2025.4 版本的标准化实验方案，针对微生物组 16S rDNA 基因扩增子测序数据的处理与分析。 /12715基于rrnDB数据库的QIIME 2插件，用于通过16S rRNA基因拷贝数（GCN）对序列进行归一化[32]Q2-qurro
甘蔗根系细菌高通量分离培养与鉴定技术
Techniques For High-throughput Isolation and Identification of Sugarcane Rhizospheric Bacteria
Authors:  毕新萍杨翼航, 利晓彤, 胡志剑, 梁志彬, 邓懿祯 and date: 08/05/2025, view: 967, Q&A: 0
样品鉴定：采用双侧标签两步法扩增样品16S rRNA基因。使用两对引物用以区分同一文库中不同样本的标签（Barcode）序列及Illumina测序所需序列，引物结构如图4所示。 图4. 16S rRNA基因两步扩增所用引物的结构. 图片通过Biorender（https://BioRender.com）生成第一轮PCR检测使用的引物见附表1中的一轮PCR引物。 一轮PCR引物是通过在16S rRNA基因的通用扩增引物
Marker Genes (16S and ITS) Protocol for Plant Microbiome Analyses
植物微生物组分析的标记基因（16S 和 ITS）实验方法
Author:  Geoff Zahndate: 04/20/2022, view: 1630, Q&A: 0
... 通常，这些数据是通过对 16S（用于细菌）或 ITS（用于真菌）扩增子进行测序而获得的，这些扩增子已使用特定样本的条形码进行标记。 ... 使用 DESeq2 对 RNA-seq 数据的倍数变化和分散进行适度估计。 基因组生物学15（12）：550。17. Lozupone , C. 和 Knight, R.