16S rRNA测序的搜索结果

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基于16S rRNA测序和RT-qPCR的硫化矿物表面微生物群落组成分析
Analysis of Microbial Community Composition on Sulfide Mineral Surface Based on 16S rRNA Sequencing and RT-qPCR
Authors:  黄珊珊马丽媛, 刘学端 and date: 04/13/2021, view: 2577, Q&A: 0
16S rRNA基因测序技术为微生物群落的组成及多样性研究提供了强有力的工具，能够识别已知和未知物种，但通常只能鉴定至属水平(Lukhele et al., 2019)。 群落组成分析3.1高通量测序1)和806R(5′-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3′)扩增DNA样本的16S rRNA基因V4区，PCR反应条件为：94 °C预变性5 min后，进行28个循环 因此，在16S rRNA测序的基础上，联合RT-qPCR技术
使用QIIME 2分析微生物组16S rRNA基因扩增子测序数据
Using QIIME 2 to Analysis Amplicon Sequencing of 16S rRNA Gene in Microbiome
Authors:  刘永鑫陈同, 钱旭波, 白洋 and date: 04/25/2021, view: 18154, Q&A: 3
Windows 10中应用商店安装Ubuntu 20.04 LTS 在Linux系统下，以Miniconda3软件和Python3虚拟环境安装QIIME 2流程；然后下载16S rRNA (可选) 训练分类器—指定V区分类器 如果扩增了指定的16S区域，还可以构建特异区域的分类器，可进一步提高分类精度。 对于混池测序末拆分样本的原始数据，需要使用QIIME (Caporaso et al., 2010) 中的脚本进行拆分，或要求测序服务商提供拆分后的单样本fastq格式测序
16S扩增子分析中常用软件及数据库应用现状
The Application Status of Commonly Used Software and Database in 16S Amplicon Analysis
Authors:  杨潇瀛张浩林, 韩莹莹, 翁强, 袁峥嵘 and date: 04/23/2021, view: 10110, Q&A: 0
16S rRNA扩增子测序 (16S rRNA amplicon sequencing) 是微生物群落研究的代表性方法，可以测得样本中的细菌及古菌。 图1. 16S rRNA结构示意图第二代测序会得到海量的原始下机数据，须通过合适的生物信息学软件加以处理分析才可得到具有可读性的数据或图表。 其中16S rRNA基因扩增子测序已成为研究细菌多样性和系统发育的基石，其以低成本、高效率的特点在人类 (Ch