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高通量siRNA文库筛选体系的建立及优化
High-Throughput siRNA Library Screening Assay Development and Optimization
Author:  韩帅date: 10/22/2021, view: 3944, Q&A: 0
高通量siRNA文库筛选流程从具体操作步骤来讲,笔者单位开展正式高通量siRNA文库筛选的常规流程如图2。共有四个大的步骤:siRNA文库制备及分装。 四、展望—siRNA筛选与CRISPR筛选高通量siRNA筛选已经成为一种非常成熟的功能基因组筛选手段,被广泛应用于生命科学的诸多研究领域。 二、建立siRNA筛选
生物钟调控基因的高通量siRNA筛选
A high-throughput siRNA Screen for Circadian Clock Modulators
Authors:  李慧林欧家丽, 唐芸棋 and date: 06/01/2021, view: 2025, Q&A: 0
SD值为标准差;C.V值为离散系数,用于评估组内数据的离散程度;Z-factor也被称作Z-因子,用于评估筛选体系是否适合高通量筛选,Z-factor值介于0.5-1.0之间时,证明筛选体系适合进行高通量筛选 细胞数量过少或太多 在正式筛选开始前,应根据实验目的和筛选策略,选择大致的细胞密度范围进行预实验,以确定筛选时的细胞密度。细胞悬液制备时,应采用多次计数求平均值的方法。 根据alamarBlue值的计算,C.V值较小,证明孔间细
全基因组siRNA高通量筛选调控Wnt/β-catenin信号转导的关键基因
High-throughput Genome-wide siRNA Screen for Key Genes Regulating Wnt/β-CateninSignaling
Authors:  毛丽宋晓敏, 李林 and date: 12/07/2021, view: 3122, Q&A: 0
Z值介于0-1之间的实验系统适合应用于高通量筛选。全基因组单基因siRNA文库筛选 在准备工作完成后,我们开始对小鼠全基因组siRNA文库进行高通量功能缺失筛选。 3)基因家族siRNA文库筛选 完成了基因家族siRNA组合文库的构建后,我们针对基因家族siRNA组合文库进行了高通量功能缺失筛选。 基因家族siRNA文库筛选结果
siRNA文库转染条件优化方法
Optimization of siRNA Library Transfection
Authors:  田维新韩帅, 陈铭 and date: 10/22/2021, view: 3650, Q&A: 0
筛选体系有已知的阳性基因,可根据阳性基因siRNA出现表型的时长确定筛选体系的时长。 反式转染是高通量siRNA筛选的主要转染方式,下文重点介绍反式转染的条件优化方法。 我们常用的siRNA转染试剂包括DharmaFECT及Lipofectamin RNAiMAX,均属于脂质体类转染试剂。每孔转染试剂的用量需要同时考虑转染效率、转染毒性及高通量筛选的成本。 对于高通量实验,反式转染是首选的转染方式,因为:1) 铺细