一、视频摘要
下胚轴长度变化是反应植物受昼夜节律、温度以及光照变化的重要指标[1-2]。在测量拟南芥本体下胚轴过程中,往往会对拟南芥的造成伤害,不利于后续的实验和数据测量,所以一种准确且不伤苗的测量方法必不可少。本视频结合Image
J软件和Graphpad
prism软件收集并处理了拟南芥下胚轴数据。
二、关键词(3-5 个关键词便于被搜索)
下胚轴、Image
J软件、Graphpad
prism软件
三、实验样品信息,试剂、耗材或仪器
1. 样品信息
拟南芥照片
2. 试剂和耗材
3. 仪器和软件
①普通电脑、
②Image
J软件、
③Graphpad
prism软件
四、实验操作
第一步
用Image
J软件打开需要测量下胚轴的植物图片
双击Image
J图标,打开软件,依次点击,File,open,选择需要测量的图片,打开。
第二步
设置比例尺
选择直线工具,量取一段已知长度,然后,依次点击,Analyze,Set
scale;
在Know
distance中输入我们的已知长度,在Unit
of length中输入长度单位,点击OK;
第三步
测量下胚轴
用放大工具,放大要测量的部位,切换为折线工具,沿着植物下胚轴描边,在英文输入状态下,按“M”键,按“Esc”键,取消选择;
重复这一步,直到测量结束;
第四步
保存数据
依次点击数据表对话框中,File,Save
as,修改文件名,点击保存;
第五步
作图
汇总数据后,打开GraphPad
Prism软件,选择合适的数据模板,点击创建,通过复制粘贴的方式导入数据,该软件能够自动生成需要的图表,只需双击需要改动的部分即可对图表进行修改;
如果有多张数据图表,可以通过点击左侧布局按钮,根据作图数目或组图需要选择布局格式,然后,双击位点就可以选择插入的数据图,点击确定,适当调整插入的结果图片,然后依次点击文件,导出,选择合适的文件格式,点击确定就可以导出结果;
五、注意事项
1.选用的图片能够清晰看到拟南芥下胚轴的结构;
2.选用的图片中必须有一段已知长度;
3.测量时,描完下胚轴后的最后一个位点不要移动,否则测量结果不准确;
4.测量时,一定要在英文状态下按“M”键;
5.在完成一次测量后,一定要按“ESC”键取消描边,否则会影响下一次的测量。
六、结果分析(可选)
七、参考文献(可选)
[1]Ince
Yetkin Çaka,Krahmer Johanna,Fiorucci Anne-Sophie et al. A
combination of plasma membrane sterol biosynthesis and autophagy is
required for shade-induced hypocotyl elongation.[J] .Nat Commun,
2022, 13: 5659.
[2]Laosuntisuk
Kanjana,Doherty Colleen J,The intersection between circadian and
heat-responsive regulatory networks controls plant responses to
increasing temperatures.[J] .Biochem Soc Trans, 2022, 50: 1151-1165.
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