一、视频摘要
实验原理：AlphaFold2是目前预测蛋白结构最准的AI软件，AlphaFold2计算需高性能GPU。Google Colab 是一个免费的云服务并支持免费的GPU。本地安装AlphaFold2软件不仅需要大量内存，而且需要高性能GPU支持。Colab上线了AlphaFold2软件，可以利用Colab上免费GPU计算，从而用AlphaFold2预测蛋白复合物结构。
实验目的：教大家如何使用Colab上AlphaFold2软件，预测蛋白复合物结构。
实验结果：利用本视频的教程，可以使用Colab-AlphaFold2在线网址预测蛋白复合物结构，只需要输入蛋白序列，即可获得AlphaFold2预测的复合物结构。
二、关键词
AlphaFold2，蛋白结构，AI预测，复合物，Colab
三、实验样品信息，试剂、耗材或仪器
1. 样品信息
视频操作教程，无样品
2. 试剂和耗材
视频操作教程，无试剂和耗材
3. 仪器和软件
Colab-AlphaFold2在线软件网址：https://colab.research.google.com/github/sokrypton/ColabFold/blob/main/AlphaFold2.ipynb
PyMoL软件（蛋白结构可视化软件）：www.phenix-online.org
四、 实验操作
1 准备好复合物目标蛋白序列；
2 打开Colab-AlphaFold2网站，并登录。将蛋白序列拷贝到Input一栏中，多个蛋白中间用英文状态下:间隔。
3 点击运行，即可开始运行AlphaFold2，预测蛋白复合物结构。
4 利用PyMol软件对解析的蛋白结构进行可视化操作。
本方法优点：不需要在本地安装AlphaFold2软件。操作简便，只需要输入蛋白序列，即可获得AlphaFold2预测的复合物结构，可以免费使用Colab的GPU计算资源。
五、注意事项
运行过程中，不能长时间离开该计算界面，否则Colab会自动切断计算资源。
六、参考文献
1. Jumper, J. et al. Nature https://doi.org/10.1038/s41586-021-03819-2 (2021).
2. Tunyasuvunakool, K. et al. Nature https://doi.org/10.1038/s41586-021-03828-1 (2021).
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