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柑橘SSR分子标记操作方法
SSR Polymorphism Analysis in Citrus
Authors:  余惠文程运江, 徐强, 邓秀新 and date: 06/12/2018, view: 6655, Q&A: 0
植物科学,植物分子生物学,DNA,分子生物学,DNA,基因分型,...
混合分子标记扩增子高通量测序方案
A Mixed Molecular Marker Amplicon Sequencing Scheme Based on High Throughput Sequencing Platform
Authors:  李佳璇张圆, 梁丹, 张鹏 and date: 01/25/2021, view: 5227, Q&A: 0
混合PCR产物高通量测序方案的实验流程图 一、 对所选分子标记进行PCR扩增 在大规模扩增分子标记之前,建议开展一个预实验,随机挑选2-3个样本和5-10种分子标记分别进行PCR扩增,目的是确保PCR反应体系 ,实现混合分子标记扩增子的高通量测序,其工作流程图如图1所示。 为保证PCR扩增成功率,推荐使用巢式PCR分别对每个分子标记进行两轮扩增 (标准PCR扩增与巢式PCR扩增的电泳结果比对图如图2)。如果分子
水稻常用分子标记(SSR InDel SNP)检测
Detection of Commonly-used Molecular Markers (SSR InDel SNP) in Rice
Authors:  孙文强申国境, 余四斌 and date: 05/10/2018, view: 10561, Q&A: 0
使用SSR标记可以先登录网站http://www.gramene.org/查询标记的退火温度和PCR产物大小,选择合适的退火温度和电泳检测条件。 琼脂糖凝胶电泳(适合InDel标记和多态性较大的SSR标记)2.1将制胶板洗净、晾干,水平放置在工作台上,两端用封条封口,放置梳子,调整好梳子的高度。 同一PAGE胶板进行多道电泳时,应根据PCR产物大小和标记在两亲本之间多态性大小,确定点样顺序和时间间隔。如果标记有拖带现象可以在点样之前将PCR产物进行96°C 3 min 变性。 PAGE胶
利用基因组数据设计通用单拷贝核基因与超保守元件分子标记方法
Streamlining Universal Single-copy Orthologue and Ultraconserved Element Design Method from Whole Genome Sequencing
Authors:  丁银环杜诗雨, 张峰 and date: 07/30/2021, view: 4994, Q&A: 0
针对这一现状,本研究开发了一套新的流程来加速开发相应的分子标记。 高通量测序成本快速降低进一步推动了产生有/无参考基因组的分子标记开发。然而,对于部分动物类群来说,全面的基因组资源十分有限。 本文提供了详细的利用基因组数据设计通用单拷贝核基因与超保守元件分子标记的分析流程,该方案的有效性已在弹尾纲的分子系统学研究中得以验证,详细内容请参阅Sun normal;"> et al. 四、BUSCO设计建议选择组装质量较好 (基因组BUSCO完整性评估>