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全基因组siRNA法筛选环形RNA的反式调控因子
Genome-wide siRNA Screen for trans-factors of Circular RNA Regulation
Authors:  李响陈玲玲 and date: 06/01/2021, view: 2837, Q&A: 0
为了鉴定直接影响circRNA的反式因子，对找到的787和1,053个基因进行基因聚类分析，最终鉴定到103个RNA结合蛋白。后续利用其他方法进行单个验证。
siRNA文库转染条件优化方法
Optimization of siRNA Library Transfection
Authors:  田维新韩帅, 陈铭 and date: 10/22/2021, view: 3647, Q&A: 0
... 筛选细胞增殖的调控基因时，需尽量保证整个实验过程中细胞处于增殖状态，若过早达到接触抑制会导致丢失阳性基因，因此起始的细胞接种密度不可过高；而在利用划痕实验 (wound-healing) 鉴定细胞迁移调控因子的筛选实验中 反式转染是高通量siRNA筛选的主要转染方式，下文重点介绍反式转染的条件优化方法。若反式转染效率不高的细胞，可开展顺式转染条件的优化，需要优化的因素及孔位排布设计与反式转染类似。 下文以TOX作为转染指示剂为例介绍反式转染优化方法。 顺式转染与反式
Identification of Expression QTL by QTLtools in a Rice Recombinant Inbred Line Population
水稻重组自交系群体中利用QTLtools鉴定QTL的表达
Authors:  Feng XiongHu Zhao, Weibo Xie and date: 06/20/2022, view: 913, Q&A: 0
... 反式作用eQTL是远离其调节的靶基因定位的eQTL ，表明靶基因的表达水平在遗传上受远端因子(例如上游转录因子)的调节。 ... 反式近似映射中使用的字段9.回归斜率在图 5 中，第 10 列是 FDR 值。 图 4. flag_leaf_eTrait_005.trans.nominal.hits.txt