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尾菜堆肥微生物组样品取样方法
Methods for Collection of Vegetable Waste Compost Microbiome Samples
Authors:
郭成
董庆
,
张超
,
周波
,
高峥
and
date:
03/10/2021,
view:
2779,
Q&A:
0
将不锈钢铲和温度计用75%酒精消毒并晾干,用不锈钢铲迅速挖至
取样
点位置插入温度计进行温度测定并记录,按照
取样
准备中的手套使用
方法
戴好手套 (防止堆肥内部高温烫伤,尤其是在高温嗜热期;尽量减少
取样
操作引入的污染 按
取样
准备中的手套使用
方法
戴好手套 (防止干冰烫伤,保持无菌),准备多个泡沫盒并装入约一半容积的干冰。将其中一盒覆盖灭菌铝箔纸并沿盒口四壁向下压成凹槽,底部接触干冰作为样品盒 (图3)。 手套使用
方法
,戴好橡胶手套之后再戴一层一次性无菌手套 (图2),橡胶手套隔热
口腔微生物组研究主要取样部位及方法
Major Sampling Sites and Methods of Oral Microbiome
Authors:
卢洪叶
张翼飞
,
张倩
,
陈智滨
,
陈峰
and
date:
04/27/2021,
view:
4068,
Q&A:
0
龈下菌斑、种植体周黏膜下菌斑常用的
方法
有:刮匙法和吸附法(滤纸条/吸潮纸尖)。两种
方法
通常选择其中一种。
取样
位点常选用目标牙位的近中颊侧和远中颊侧,能尽量避免唾液污染,
取样
难度较小。 非刺激性唾液样本采集的
方法
有两种:
方法
一,受试者手持唾液收集容器;静坐,低头,口微张、睁开眼、头微微前倾;避免吞咽,先将唾液聚集在口底,再吐到容器内。 采样前准备:
取样
前请受检者清水漱口,去除口中可能含有的食物残渣。样本采集与转运:首先,用无菌棉球隔湿
取样
位点。
方法
Total RNA Extraction from Dinoflagellate
Symbiodinium
Cells
沟鞭藻共生藻细胞的总RNA提取
Author:
Tingting Xiang
date:
06/05/2018,
view:
4634,
Q&A:
2
... 这种
取样
方法
可以防止收获后mRNA的合成或降解。注意:本研究中使用的菌株是Symbiodinium SSB01(Xiang et
水稻根系微生物组研究中的样本种植、取样和16S rRNA 基因扩增子文库制备方法
Planting, Sample Collection and Library Preparation of 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing for Rice Root Microbiomes
Authors:
徐浩然
张婧赢
,
郭晓璇
,
曲宝原
,
刘永鑫
,
白洋
and
date:
04/27/2021,
view:
4532,
Q&A:
1
水稻种子培养
方法
. A. 灭菌种子铺板位置; B. 竖直培养
方法
。 为防止培养基中残留的营养在移栽后对植物生长发育产生影响,需去除根系残留培养基。 使用PicoGreen DNA定量试剂盒对胶回收产物进行定量,
方法
参照步骤20-26。 混合同一文库样本。 使用Beckmen Coulter Agencourt AMPure XP核酸纯化试剂盒对文库DNA进行纯化以获得纯净的文库DNA样本,
方法
参照第一轮PCR产物的纯化。 此实验
方法
已经在Nature Biotechnology (Zhang et al.
跳虫标本的采集、制作与保存
Collection, Production and Preservation of Collembola Specimen
Authors:
鄢麒宝
乌云嘎
,
吴东辉
,
孙新
and
date:
07/30/2021,
view:
3495,
Q&A:
0
... 当实验数据需应用于统计分析时,需要采用随机
取样
等客观
取样
方法
,例如在每个采样地点随机选取4个1 m × 1 m的采集单元,各采集单元间至少相距100 m,使用铁丝框在每个采集单元中随机选取3个200 mm 确定采集样点后,抓
取样
点上方的凋落物,装入自封袋中。凋落物采集后,将土钻打入下方土壤,取出土壤表层50 mm或100 mm的土芯,装入新的自封袋中。 1.3灌丛生境 根据实验目的选
取样
点后,将搪瓷解剖盘置于灌丛下方,自上而下拍打灌从,令跳虫抖落于解剖盘内,即刻使用吸虫器进行采集。或在植物表面挥
啮齿类动物的野外采集与标本制作
A Protocol for Field Collection and Specimen Preparation of Glires
Authors:
葛德燕
程继龙
,
温知新
,
Anderson Feijó
,
夏霖
,
杨奇森
and
date:
11/11/2021,
view:
3209,
Q&A:
0
... 比如:为了调查物种多样性海拔分布格局的季节性变化,针对每条样线上的海拔点分为早湿季 (4至6月) 和晚湿季 (7至9月),按照海拔由低到高的顺序进行重复
取样
,两个季节中的
取样
方法
和
取样
强度保持一致。 我们对采样
方法
进行标准化设计,从而保证研究的一贯性和不同样线上结果的可对比性。 两种标本制作过程中有区别的地方如下表对比所示,其中开口位置、填充物质和缝合
方法
略有区别 (表4)。表4. 比较安全的
方法
是将老鼠转移到厚塑料袋中 (> 20丝),将其赶到袋子角落处
土壤线虫采集、标本制作与数据分析
Soil Nematode Collection, Specimen Preparation and Data Analysis
Authors:
骆静梅
张晓珂
,
梁文举
and
date:
07/15/2021,
view:
6624,
Q&A:
0
... 常规
取样
按五点法,"S"或"W"型等
方法
进行随机
取样
;由于大多数线虫分布在0?30 cm土层,因此大多数
取样
的土层深度应该在这个范围之内,根据不同采集目的,也有采集0?100 例如,如果
取样
方法
不当,土壤样品不具有代表性,就可能对试验结果产生很大的影响,就无法得出正确的结论。常规土壤线虫的
取样
目的主要包括线虫群落调查、线虫病害诊断、线虫分类研究等 (张晓珂等,2013)。 合理的
取样
及提取
方法
、
Cas-16S-seq:利用CRISPR/Cas9靶向消除16S-seq中高丰度植物序列的方法
Cas-16S-seq: Using CRISPR/Cas9 to Eliminate Abundant Plant Sequences in 16S-seq
Authors:
宋露洋
谢卡斌
and
date:
04/13/2021,
view:
2942,
Q&A:
0
三、植物根系样品的分离和基因组DNA纯化水稻根系
取样
方法
。戴上丁腈手套并利用75%医用酒精进行消毒,握住水稻嫩枝直接拔取种植在田间水稻全株根系,避免对根系组织造成损伤。 Cas-16S-seq建库
方法
(Cas9+)和常规16S-seq建库
方法
(Cas9-),#1-#3代表的是三个生物学重复,*代表水稻线粒体799F-1193R的扩增子序列。 注:研磨钵和研磨棒以及液氮是主要污染来源,需要经过多次双蒸水清洗以及高温高压灭菌处理 (或酒精灼烧),防止细菌或残留植物组织污染,同时在整个
取样
,根系清洗以及研磨