定量宏转录组的搜索结果

  • Peer-reviewed
  • Preprint
  • Extracted from published research articles
  • 生物化学
  • 生物信息学与计算生物学
  • 生物物理学
  • 癌症生物学
  • 细胞生物学
  • 发育生物学
  • 免疫学
  • 微生物学
  • 分子生物学
  • 神经科学
  • 植物科学
  • 干细胞
  • 系统生物学
  • 相关性
  • 日期
  • 浏览量
微生物组的定量宏基因组学和定量宏转录组学方法
Quantitative Metagenomics and Metatranscriptomics Methods of Microbiome
Authors:  黄昕瑜张璐, 袁凌, 鞠峰 and date: 04/13/2021, view: 6331, Q&A: 1
内标的回收与基础生物信息学分析6.1数据前处理6.1.1定量转录数据前处理 1)质控 用PRINSEQ对转录的原始序列进行过滤,除去adapter,除去包含模糊碱基(ambiguous bases XJ220A SCS)Nanodrop OneC(Thermo)涡旋混合器(杭州奥盛 MTV-1)实验步骤内标序列和PCR引物的设计与合成 本流程通过人工合成的DNA和RNA内标物投加来实现微生物群落的定量宏基因学和定量
土壤宏转录组样本制备
Soil Sample Preparation of Microbial Communities for Metatranscriptomics
Authors:  贝水宽彭静静 and date: 04/12/2021, view: 4161, Q&A: 0
b 图样品中16S rRNA和23S rRNA去除程度高,mRNA富集程度好,适合进行下游反转录转录文库构建,而c图样品中16S rRNA和23S rRNA残留程度相对较高,mRNA富集程度较差。 转录文库构建 基于NEBNext? Ultra? Directional RNA Library Prep Kit for Illumina (New England Biolabs, USA) 试剂盒 international.neb.com/protocols
野生动物微生物组数据平台构建的技术方法和实践挑战
Technical Frameworks and Practical Challenges in Developing Wildlife Microbiome Databases
Authors:  王恺毅杨蕊菁, 李雨霏, 赵李頔涵, 闫利平, 王海燕, 高云云 and date: 02/05/2026, view: 250, Q&A: 0
宏基因转录蛋白代谢等不同层次的数据在同一平台上的融合,不仅可以更全面地解析微生物群落的结构与功能,还能为系统生物学和精准医学研究提供更丰富的参考 [43]。 Animal-APAdb [21] 专注于动物RNA-seq数据的可变多聚腺苷酸化调控信息,从宿主转录调控的角度补充了学数据,但并非直接的微生物数据库,需要与宏基因转录
RNA病毒组与生物信息学分析
RNA Virome and Bioinformatics Analysis
Authors:  张誉译陈毅聪, 魏小曼, 崔杰 and date: 06/11/2021, view: 5143, Q&A: 0
2017年,ICTV宣布将通过宏基因转录的方法发现的病毒加入正式的病毒学分类体系 (Simmonds et al., 2017)。 人们不需要再颇费周章地寻找合适的病毒培养体系或模式动物,直接将感兴趣的样品构建成测序文库 (Library),通过宏基因 (Meta-genomics) 或转录 (Meta-transcriptomics Zhang等人在他们的一篇评论中详细地介绍了利用宏基因学、