Improve Research Reproducibility
A Bio-protocol resource
实验方案
研究领域
癌症生物学 (448)
发育生物学 (338)
分子生物学 (1197)
干细胞 (266)
免疫学 (618)
神经科学 (737)
生物化学 (1439)
生物物理学 (183)
微生物学 (1191)
系统生物学 (358)
细胞生物学 (2235)
植物科学 (1097)
Bio-protocol
期刊
Bio-101 实验手册
课题组实验方案合辑
Request a Protocol
作者指南
关于
提交实验方案
订阅
A high-quality database for basic life science protocols
实验方案
研究领域
癌症生物学 (448)
发育生物学 (338)
分子生物学 (1197)
干细胞 (266)
免疫学 (618)
神经科学 (737)
生物化学 (1439)
生物物理学 (183)
微生物学 (1191)
系统生物学 (358)
细胞生物学 (2235)
植物科学 (1097)
Bio-protocol 期刊
Bio-101 实验手册
课题组实验方案合辑
Request a Protocol
订阅
提交
提交实验方案
作者指南
关于
定量宏转录组的搜索结果
Peer-reviewed
Preprint
Extracted from published research articles
生物化学
生物信息学与计算生物学
生物物理学
癌症生物学
细胞生物学
发育生物学
免疫学
微生物学
分子生物学
神经科学
植物科学
干细胞
系统生物学
研究物种
节肢动物
鱼类
真菌
无脊椎动物
哺乳纲
其它脊椎动物
植物
原核生物
原生动物
病毒
蠕虫
相关性
日期
浏览量
微生物组的定量宏基因组学和定量宏转录组学方法
Quantitative Metagenomics and Metatranscriptomics Methods of Microbiome
Authors:
黄昕瑜
张璐
,
袁凌
,
鞠峰
and
date:
04/13/2021,
view:
6331,
Q&A:
1
内标的回收与基础生物信息学分析6.1数据前处理6.1.1
定量
宏
转录
组
数据前处理 1)质控 用PRINSEQ对
宏
转录
组
的原始序列进行过滤,除去adapter,除去包含模糊碱基(ambiguous bases XJ220A SCS)Nanodrop OneC(Thermo)涡旋混合器(杭州奥盛 MTV-1)实验步骤内标序列和PCR引物的设计与合成 本流程通过人工合成的DNA和RNA内标物投加来实现微生物群落的
定量
宏基因
组
学和
定量
土壤宏转录组样本制备
Soil Sample Preparation of Microbial Communities for Metatranscriptomics
Authors:
贝水宽
彭静静
and
date:
04/12/2021,
view:
4161,
Q&A:
0
b 图样品中16S rRNA和23S rRNA去除程度高,mRNA富集程度好,适合进行下游反
转录
和
宏
转录
组
文库构建,而c图样品中16S rRNA和23S rRNA残留程度相对较高,mRNA富集程度较差。
宏
转录
组
文库构建 基于NEBNext? Ultra? Directional RNA Library Prep Kit for Illumina (New England Biolabs, USA) 试剂盒 international.neb.com/protocols
野生动物微生物组数据平台构建的技术方法和实践挑战
Technical Frameworks and Practical Challenges in Developing Wildlife Microbiome Databases
Authors:
王恺毅
杨蕊菁
,
李雨霏
,
赵李頔涵
,
闫利平
,
王海燕
,
高云云
and
date:
02/05/2026,
view:
250,
Q&A:
0
宏基因
组
、
宏
转录
组
、
宏
蛋白
组
、
宏
代谢
组
等不同层次的数据在同一平台上的融合,不仅可以更全面地解析微生物群落的结构与功能,还能为系统生物学和精准医学研究提供更丰富的参考 [43]。 Animal-APAdb [21] 专注于动物RNA-seq数据的可变多聚腺苷酸化调控信息,从宿主
转录
调控的角度补充了
组
学数据,但并非直接的微生物
组
数据库,需要与宏基因
组
或
宏
转录
RNA病毒组与生物信息学分析
RNA Virome and Bioinformatics Analysis
Authors:
张誉译
陈毅聪
,
魏小曼
,
崔杰
and
date:
06/11/2021,
view:
5143,
Q&A:
0
2017年,ICTV宣布将通过宏基因
组
或
宏
转录
组
的方法发现的病毒加入正式的病毒学分类体系 (Simmonds et al., 2017)。 人们不需要再颇费周章地寻找合适的病毒培养体系或模式动物,直接将感兴趣的样品构建成测序文库 (Library),通过宏基因
组
(Meta-genomics) 或
宏
转录
组
(Meta-transcriptomics Zhang等人在他们的一篇评论中详细地介绍了利用宏基因
组
学、
宏