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基于微量热曲线的微生物群落代谢特征分析
Analysis of Microbial Community Metabolic Characteristics Based on Kinetics of Micro-heat Release
Authors:  陈瑞蕊井忠旺, 俞冰倩, 林先贵, 冯有智 and date: 04/12/2021, view: 2694, Q&A: 0
，表征微生物群落最大潜在活性，Pmax越大说明微生物群落最大潜在活性越高；Tmax，图中Pmax所对应的时间，表征微生物群落的响应速度，Tmax越小说明微生物群落的响应越快；QT，培养过程总的热散逸 ( 微量热曲线及参数获取 进一步可以用指数方程 (Eqn. 1和Eqn. 2) 来拟合微量热曲线，式中k表示微生物群落的生长速率常数，也称微生物群落的比生长速率，通过Eqn
基于BIOLOG的微生物群落碳代谢功能分析
Analysis of Microbial Community Carbon Metabolism Function Based on BIOLOG
Authors:  陈瑞蕊俞冰倩, 张建伟, 林先贵, 冯有智 and date: 01/25/2021, view: 8538, Q&A: 0
农药污染对土壤微生物群落功能多样性的影响. 根据96小时的光吸收值，计算得到麦田土壤微生物群落的Shannon、Simpson和McIntosh 指数 (表1) ，可以发现，臭氧浓度升高4年后，土壤微生物群落碳代谢功能的丰富度和优势度都没有显著变化 臭氧浓度升高和对照条件下土壤微生物群落的碳源利用在主成分1 (Principal component 1, PC1) 和主成分2 (PC2) 上发生显著分异，说明臭氧浓度升高对麦田土壤微生物
微生物群落构建过程的空间可视化方法
Spatial Visualization of Microbial Community Assembly Processes
Authors:  闫慧贞王凯, 张德民 and date: 02/10/2021, view: 4628, Q&A: 0
将成对采样站位之间的微生物群落构建过程映射在地图上，即可反映出研究区域中各种生态过程的地理空间分布格局。 ，实际操作中可根据研究区域针对性选用地图图层) 结合，即可生成微生物群落构建过程的空间分布图 (图8)。 微生物群落构建过程的地理空间分布图图9. 线条属性设置窗口 致谢本项工作得到了国家自然科学基金委员会 (项目编号：41977192) 的资助。参考文献Esri, Redlands, CA. 本教程用成对站位间不同颜色的连线来表示站位间的各类生态过程，操作步骤如下：示例数据来源 本
利用GeoChip分析环境微生物功能基因群落结构
Analysis of Microbial Functional Gene Community Structure in Environmental Samples by GeoChip
Authors:  郭雪杨云锋 and date: 06/01/2021, view: 3122, Q&A: 0
三江源典型高寒草甸不同海拔梯度土壤微生物研究. 硕士学位论文. 青海师范大学谢建平. (2011). 功能基因芯片 (GeoChip) 在两种典型环境微生物群落分析中应用 的研究. 博士学位论文.
原核微生物群落随机性和确定性装配过程的计算方法
Calculation Method for Stochastic and Deterministic Assembly Processes of Prokaryotic Communities
Authors:  赵维王兴彪, 侍浏洋, 朱婉瑜, 马磊, 王敬敬, 徐松, 杨榕, 张小霞, 韩一凡, 黄志勇 and date: 03/25/2021, view: 8608, Q&A: 0
在解释原核微生物群落构建机制中，零模型是群落数据或者进化树数据进行随机化的方式。 在实际研究中，针对微生物群落的研究显示MNTD对肠道微生物群落的宿主选择性更敏感 (Youngblut et al.，2019)，而针对草本植物群落的研究则显示NRI和βMNTD与海拔梯度之间存在显著线性关系 对于原核微生物群落而言，环境中的微生物种类只能尽最大的可能通过高通量、高分辨率的分析方法获得，但是仍然无法完全
海洋环境资源状态划分及微生物群落生态位宽度计算方法
Partitioning of Resource States in the Marine Environment and Calculation of Niche Breadth of Microbial Community
Authors:  闫慧贞张德民, 王凯 and date: 04/20/2022, view: 5600, Q&A: 0
在计算海洋微生物群落的生态位宽度时，首先要准确评估研究区域的资源状态数量，但在高度连通且复杂多变的海洋环境中评估资源状态数难度较大。 群落水平的生态位宽度Bcom计算R代码如下（图7）：图7. 注：加粗代表最佳分组方式将微生物OTU表转化为微生物-资源状态分布表 按照上一步得到海区站位资源状态分布情况，把属于同一资源状态的所有站位中各物种丰度分别求和，即为该资源状态下的物种分布情况。 计算物种水平生态位宽度的R代码计算得到每个物种的标准化生态位宽度BA后（图6），计算单个样本中所有物种的生态位宽度BA平均
基于16S rRNA测序和RT-qPCR的硫化矿物表面微生物群落组成分析
Analysis of Microbial Community Composition on Sulfide Mineral Surface Based on 16S rRNA Sequencing and RT-qPCR
Authors:  黄珊珊马丽媛, 刘学端 and date: 04/13/2021, view: 2483, Q&A: 0
16S rRNA基因测序技术为微生物群落的组成及多样性研究提供了强有力的工具，能够识别已知和未知物种，但通常只能鉴定至属水平(Lukhele et al., 2019)。 因此，在16S rRNA测序的基础上，联合RT-qPCR技术精确定量Acidithiobacillus属的不同功能类群，能够更加全面揭示浸出过程中群落组成及演替规律，为冶金微生物的浸出行为及机理研究奠定基础 ferrivorans、A. thiooxidans和A. caldus的扩增比例，带入16S rRNA测序结果中Acidithiobacillus