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柑橘根际和根表微生物组样品的收集及核酸提取方法
A Protocol for Citrus Rhizosphere and Rhizoplane Microbiome Sample Collection and Nucleic Acid Extraction
Authors:  张云增徐进, Riera Nadia, 王年 and date: 04/12/2021, view: 3363, Q&A: 0
按试剂盒说明书进行操作提取微生物组的总RNA，共20个步骤。 该方法已应用于研究黄龙病对柑橘根部微生物组的影响 (ref. 4，该研究受到Florida Citrus Research and Development Foundation的资助) 。 此步骤需在冰上或者冷室内操作并迅速完成，从根表面刷取土壤到将土壤置于LifeGuard soil preservation solution的时间要在2 min中内完成，避免土壤在空气中水分丧失和温度上升而对样品内微生物组成和基因表达产生明
植物微生物组DNA提取扩增及溯源分析
DNA Extraction, Amplification and Source-tracking Analysis for Plant Microbiomes
Authors:  熊 超贺纪正, 张丽梅 and date: 04/27/2021, view: 3868, Q&A: 0
重复第6条步骤，分别探究叶内、根表、根内等其他植物部位微生物组的潜在来源。 例如首先探究叶表微生物组的来源，在metadata.txt文件中将'' SourceSink ''列下所有叶表样品命名为sink，其他潜在的来源如非根际土壤、根际土壤、根表等样品命名为 ，所有来自叶表的样品分组名字为sink)，其次可能的
水稻根系互作功能微生物的筛选方法
Screening Method of Functional Microorganisms Interacting with Rice Roots
Authors:  赵金彤刘晓青, 韩东飞, 伍宁丰, 田健 and date: 04/27/2021, view: 3846, Q&A: 0
观察不同处理组的水稻生长情况，拍照记录，对比不同处理组的表型差异。将水稻幼苗从蛭石培养基质中小心地拨出，以减少对水稻根部和叶片的破坏。测定每盆水稻的根和茎的长度。 2)水稻根内微生物的筛选分离及纯化保存 将水稻根系清洗干净，称取1-2 g水稻根，用剪刀剪成小段于已灭菌的150 ml三角瓶中，加入50 ml 75%乙醇浸洗10 min，倒掉乙醇，用无菌水清洗3次，加入 50 μl扩增体系如表2：表2. 50 μl扩增体系如表3：表3. 1.2水稻根系功能
利用无菌植物和可培养细菌体系研究根系微生物组功能
Utilization of Axenic Plants and Cultivated Bacteria for Studying Root Microbiota’s Function
Authors:  徐浩然张婧赢, 曲宝原, 刘永鑫, 白洋 and date: 04/27/2021, view: 3683, Q&A: 0
研究背景以群落形式聚集于植物根内或根表的根系微生物组 (Microbiota) 以其促进植物生长、帮助植物营养吸收 (Zhang et al., 2019)、抵抗极端环境 (Xu et al., 2018 因此，研究根系微生物组与植物间的关系有着重要价值。生态学方法通常直接研究植物与根系微生物的整体，这对于揭示自然环境中微生物组的组成结构等至关重要。 挑选长势一致的植物无菌苗，使用无菌镊子将无菌苗从培养基中拔出，用无
微生物群落构建过程的空间可视化方法
Spatial Visualization of Microbial Community Assembly Processes
Authors:  闫慧贞王凯, 张德民 and date: 02/10/2021, view: 4660, Q&A: 0
本教程用成对站位间不同颜色的连线来表示站位间的各类生态过程，操作步骤如下：示例数据来源 本教程描述的微生物群落构建过程空间可视化方法由本课题组首次提出并应用 (Wang et al., 2019)，因此以该论文中的部分数据作为示例数据 XY ToLine工具 (Esri, Redlands, CA) 生成采样站位成对连线图层2.1组织采样站位经纬度表 (使用Excel) 将站位经纬度坐标转换为十进制。 表格链接参数设置4.2根据群落构建过程为成对站位连线赋色 右击成对站位连线图层，“点集两两连接_XY
野外树木根系取样及根际土收集操作规程
Protocol for Sampling of Root and Rhizosphere Soils from Trees in Natural Fields
Authors:  何兴华杨预展, 袁志林 and date: 03/25/2021, view: 6887, Q&A: 0
因此，研究树木细根的根际微生物对提高林木生产具有重要意义。 使用修枝剪剪取细根，每棵树木收集至少10 g根系样品。每个处理组至少5个生物学重复，一般推荐10个生物学重复。将收集的根系样本分装至无菌采样袋中并做好标记，密封保存。 收集的根际土壤样品可直接进行后续实验，或液氮速冻后，置于-80 °C超低温冰箱保存。图3. 根际、根表和内生示意图 (图片引自Edwards等, 2015)图4. 制定采样记录表，包括如下内容