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野外树木根系取样及根际土收集操作规程
Protocol for Sampling of Root and Rhizosphere Soils from Trees in Natural Fields
Authors:
何兴华
杨预展
,
袁志林
and
date:
03/25/2021,
view:
6891,
Q&A:
0
三、 实验室
根
际
土
收集
按以下步骤
收集
根
际
土
:在超净工作台内抖落根系的bulk soils (即非
根
际
土
),附着在根部约1mm厚的土壤被定义为
根
际
土壤 (图3) (Edwards et al., 2015 低温运送至实验室进行
根
际
土
的
收集
。
根
际
土
利用
acdSf3
/
acdSr4
引物快速鉴定产ACC脱氨酶细菌
acdSf3
/
acdSr4
Primer pair for Rapid Identification of ACC Deaminase Producing Bacteria
Authors:
张宇薇
彭龙
,
袁志林
,
秦媛
,
潘雪玉
and
date:
06/17/2021,
view:
3067,
Q&A:
1
... 将离心管放置在涡旋振荡器上充分振荡5 min,使
根
际
土
悬浮于缓冲液中。取出根系样品,将
根
际
土
悬浮液10 °C下6,000 × g 离心15 min,倒掉上清液,
收集
根
际
土
,放置于4 °C冰箱内保存。 三、
根
际
土
的
收集
取树木根系样品,抖落
根
外
土
,将带有
根
际
土
柑橘根际和根表微生物组样品的收集及核酸提取方法
A Protocol for Citrus Rhizosphere and Rhizoplane Microbiome Sample Collection and Nucleic Acid Extraction
Authors:
张云增
徐进
,
Riera Nadia
,
王年
and
date:
04/12/2021,
view:
3363,
Q&A:
0
根
表土壤
收集
将去除根
际
土壤的细
根
置于含预冷PBS的50 ml离心管中,使用超声波震荡方法
收集
根
表土壤。
根
际
土壤
收集
将无菌铝箔铺到冰盒上方,注意保持铝箔上方干燥。 注:步骤3和步骤4动作要迅速,尽可能3个操作人员进行流水线作业,每人负责一个环节 (
收集
细
根
、
根
际
土壤样品
收集
和
根
表土壤样品
收集
) ,完整处理完
甘蔗根系细菌高通量分离培养与鉴定技术
Techniques For High-throughput Isolation and Identification of Sugarcane Rhizospheric Bacteria
Authors:
毕新萍
杨翼航
,
利晓彤
,
胡志剑
,
梁志彬
,
邓懿祯
and
date:
08/05/2025,
view:
915,
Q&A:
0
... 使用无菌镊子将超声处理后的根系组织样品夹出,
收集
根
际
土
浸出液。将
根
际
土
浸出液在2,000 rpm(4 ℃)条件下离心30 min,吸取上清存于2 mL离心管中,获得
根
际
土
原液,置于冰盒中备用。 将
根
际
土
原液按照步骤1中稀释根系组织研磨原液的方法进行稀释,得到10-4的
根
际
土
稀释液。 ,保留附着在根系表面
小麦相关微生物的野外采样与样品保存
Field Sampling and Sample Storage of Wheat-associated Microbiomes
Authors:
马玉颖
褚海燕
and
date:
04/22/2021,
view:
2684,
Q&A:
0
... 上述小麦根
际
土
、
根
、茎、叶等样品袋封好口后,置于-40 °C 冰箱保存即可,若需长期保存,请置于-80 °C冰箱保存。 ,保存为小麦根
际
土
样品。 实验室中利用小毛刷 (提前灭菌) 将紧密附着在根系表面的土壤刷下来,尽量刷到根系表面无明显的土壤颗粒 (土壤和根系颜色一般有明显差异,可以通过颜色来辨别是否刷得较为干净了),
收集
到10 ml无菌离心管中 如果需要测定小麦内生微生物,则需要在剪碎样品前,对小麦的
根
、茎、叶等组织进行表面消毒处理,以去除表面微生物。
原位酶谱法高分辨率实时检测土壤微界面酶活分布
High Resolution Real-time Detection of Soil Enzyme Activity Distribution by
in situ
Zymography
Authors:
魏晓梦
魏亮
,
郝存抗
,
祝贞科
,
吴金水
,
葛体达
and
date:
04/29/2021,
view:
4918,
Q&A:
2
...
根
际
范围定量:从
根
际
中心到非
根
际
土壤酶活性会有快速降低至平稳的变化趋势,可将该距离视为
根
际
范围。 3.2将
根
盒
根
窗面向上水平放置,小心打开
根
窗,整个过程应均匀用力,保持
根
土
界面的完整性。 培养时可用重物压紧
根
窗,保证
土
样与膜紧密接触且各部位受力均匀。 (pixels) 及图片分辨率将横轴单位转换为mm即可得到
根
植物微生物组DNA提取扩增及溯源分析
DNA Extraction, Amplification and Source-tracking Analysis for Plant Microbiomes
Authors:
熊 超
贺纪正
,
张丽梅
and
date:
04/27/2021,
view:
3869,
Q&A:
0
... 使用铁铲/
土
钻采集距离根系20 cm外的表层
土
(0-15 cm) 作为非
根
际
土壤,每个小区进行5点取样,混合均匀后作为一个生物重复。 对于
根
际
及非
根
际
土壤DNA,称取0.4 g土壤样品使用PowerSoil DNA 提取试剂盒按照说明书进行DNA提取。 、
根
际
土壤、
根
表等环境可能是叶表的潜在来源,其样品分组名字均为source)。 例如首先探究叶表微生物组的来源,在metadata.txt
利用
13
C-DNA-SIP法示踪根际和菌丝际活性解磷细菌
13
C-DNA-SIP Method for Tracing Rhizosphere and Hyphosphere Phosphate Solubilizing Bacteria
Authors:
周家超
冯固
and
date:
04/13/2021,
view:
3738,
Q&A:
0
八、 样品收获 标记结束后的第二天,拆除标记装置,破坏性取样,地上部分用去离子水洗净,吸水纸擦干,地下部分首先用抖
根
法
收集
菌根
际
土壤,一部分存储于室温用于δ13C的测定,另一部分于-20 菌丝
际
基质一部分保存于室温条件下,用于δ13C的测定。另一部分储存于-20°C,用于菌丝的
收集
和DNA的提取。 此外,土壤的一部分过30 μm筛,用于后续菌丝的
收集
。 九、 δ13C的测定 菌根
际
土壤和菌丝
际
土壤13C丰度用δ13C‰表