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湖泊水体环境DNA的采集、提取与鱼类遗传标记的扩增
Collection and Extraction of Lake Water Environmental DNA and Amplification of Fish Genetic Markers
Authors:  舒璐潘红梅, 彭作刚 and date: 10/15/2021, view: 3549, Q&A: 0
DNA的获取水体环境DNA的采集1.1水样采集1)采样点的设置 根据水体流域大小与监测目的，设置若干采样点。 此外，由于水体中环境DNA动态机制的复杂性（Barnes and Turner, 2015），通过环境DNA序列丰度评估物种相对生物量的准确性还有待进一步的研究（Ushio et al., 2018）。 水体环境DNA的提取 参照强力水样DNA提取试剂盒 (PowerWater DNA Isolation Kit) 的说明书提取滤膜DNA。
土壤和水体环境T4型细菌病毒g23基因多样性研究
Genetic Diversity of the Major Capsid Genes (g23) of T4-type Bacteriophages in Soil and Water Environments
Authors:  刘俊杰荆瑞勇, 王光华 and date: 01/10/2021, view: 5635, Q&A: 0
研究中涉及含水量较大，如湿地和稻田环境土壤，提取DNA前需要对新鲜土壤样本进行冷冻干燥，降低其含水量。此外，为增加水体DNA的提取效率，可将300 ml水体过滤样本增加到500~1,000 ml。 根据笔者经验，不同环境样本中g23基因片段大小在350~600 bp之间。 二、水体DNA提取取300 ml水样，在10,000 × g、4 °C条件下离心10 min，以除去土壤颗粒、浮游生物等。 注意事项本研究是以T4型细菌病毒g23为例，介绍了环境噬菌体多样性的研究方法。
基于DNA宏条形码的水体浮游细菌群落测序建库方法
Library Construction for DNA Metabarcoding of Bacterioplankton Communities in Waters
Authors:  肖鹏续子杰, 杨军 and date: 04/27/2021, view: 2402, Q&A: 0
S1000)电泳仪 (北京六一, DYY6C)电泳槽 (北京六一, JYCP31DN)凝胶成像仪 (上海培清, JS-680B)核酸测定仪 (ThermoFisher, Qubit 4.0)实验步骤水体环境样品
鱼类野外采集与标本制作保存
Collection, Preparation and Preservation of Fish Specimens
Authors:  林峰秦涛, 陈小勇, 张洁 and date: 10/15/2021, view: 7980, Q&A: 0
... 二、标本采集基本方法和过程标本直接采集 在采集地采集前和过程中，应随时注意气候变化、水位变化及周边环境情况。在保证人身安全的情况下，根据不同水体环境采用相适合的、较为有效的捕捞工具，至少两人协同采集。 伞型地笼 (洞穴环境下放置，周佳俊 摄) 提 (搬) 罾是一种小型用木棍或竹竿做支架的方形定置网具，常用于湖泊、水库和缓流水体捕捞鱼虾 (刘松岩，2013)。 在各水体采集鱼类标本，利用钓鱼竿 (由钓竿和单丝线组成) 也是一种常见的方法。由于饵料的不同，垂钓对采集的鱼
微生物群落胞内/胞外吸附/胞外游离水环境DNA的分离提取
Isolation and Extraction of Intracellular, Absorbed-extracellular and Free-extracellular Environmental DNA from Aquatic Microbial Community
Authors:  赵泽鞠峰 and date: 12/25/2020, view: 7696, Q&A: 0
注：不同环境水体中胞外游离DNA的含量不同，甚至同一环境水体部分采样点之间含量差别也较大。建议通过预实验确定不同环境水体需要处理滤液的合适体积，以保证所得DNA满足下游实验需求。 河流、湖泊、近岸海水等环境水体建议过滤水样1 L及以上，远海海水等较为洁净的环境水体需增加过滤水样体积。不同环境水体样品建议通过预实验确定合适的过滤体积，以保证提取得到的DNA满足下游实验要求。 环境
水体浮游植物采集与鉴定
Sampling and Identification of Phytoplankton in Water
Authors:  金磊杨义刚, 杨军 and date: 04/27/2021, view: 5031, Q&A: 0
浮游植物对环境变化响应十分迅速，其物种组成、生物量、优势种及群落变化可作为衡量水体生态系统状态的重要指标。 近年来，蓝藻水华成为危害内陆水体生态环境的重要问题，全球范围内蓝藻水华的暴发频率、规模和持续时间都在增加，导致生物多样性丧失、生态功能退化、水质恶化等一系列生态问题。 通过浮游植物调查，可以有效地反映水生态系统的健康状况，在水资源利用、水环境管理和水生态保护等领域具有重要意义。 致谢感谢国家自然科学基金项目（31370471）和福建省自然科学基金项目（2019J02016）的资助，感谢中国科学院城市
淡水浮游细菌群落采集、过滤与保存
Sampling, Filtration and Storage of Freshwater Bacterioplankton Community
Authors:  续子杰肖鹏, 杨义刚, 杨军 and date: 04/29/2021, view: 2865, Q&A: 0
... 1.1选择合适的采样站位，使用测深仪测量水深，现场拍照并记录采样时间 (精确到分钟)、天气和周围环境情况。 如果仅采集表层水体样品，则通常只需测定距离水体表面0.5 m处的水质参数。 富营养化较严重的水体过滤水样体积约100–200 ml，中营养水体过滤水样体积大约800–1000 ml，贫营养水体过滤水样体积可超过2000 ml。 1.3明确水体分层状况 (以温跃层或氧跃层为例)：根据水温在水体垂直剖面分布情况并确定温度急剧变化的水层 (温跃
水螨标本采集、保存及玻片标本制作
Collection and Preservation of Water Mites and Preparation of Slide Specimens
Authors:  古欣瑶李海涛, 金道超, 郭建军 and date: 12/14/2021, view: 2979, Q&A: 0
... 水螨螨体较小 (小型类群体长约150 μm，大型类群达5000 μm，多数类群体长约500-1000 μm)，对水环境变化极敏感，水体的轻微污染也可导致水螨种群锐减，甚至是灭绝，因而水螨是生境水体质量优劣的指示性生物 研究背景水螨 (Water mite)
斑马鱼的自然交配产卵及胚胎培养技术
Natural Breeding and Embryo Culture of Zebrafish
Authors:  柳力月李玲璐, 潘鲁湲, 李阔宇, 孙永华 and date: 03/08/2022, view: 13921, Q&A: 1
... 原缸水体经鱼过夜排泄废物，氨氮含量可能过高，换水可以降低水体氨氮含量，保持水体清洁度，同时适量减少缸内水量，水层浅有助于雌雄鱼交配产卵。 交配环境不利于斑马鱼繁殖。交配环境中的水温和室温太高或者太低均不利于斑马鱼追逐产卵，光照周期紊乱会直接造成斑马鱼不产卵，配种缸内水位过高也会影响雌雄鱼追逐产卵。 斑马鱼的自然寿命约3到5年，实验室环境下性成熟期约为3个月，而6至18月龄的斑马鱼繁殖能力较强。 因斑马鱼在生理和行为学上呈现出明显的昼夜节律，光暗周期的变化可直接启动其生物节律进而影
溪流底栖附着生物膜的野外采集方法
Field Collection Method of Stream Benthic Biofilm
Authors:  李明家王建军 and date: 04/27/2021, view: 2619, Q&A: 0
... 现场记录环境数据及四周环境拍照四、 样品的保存及运输 每天结束采样工作之后，要对所采集到的样品进行及时冷冻。 采样人员3穿水鞋或者连体下水裤，下水准备进行石头的捡取，和水体物理指标 (流速、溪流深度、宽度等) 的测量 (图1B)。 生物膜采集现场照片采样人员1在记录好水体的理化性质以及采样点的特征之后，使用手机对溪流现场进行拍照，以采样人员2所在的位置为中心，拍取采样点的上游、下游和四周的现场情况 (图3)。图3. 采样人员1使用手持GPS、pH计和电导率仪，对现场物理指标 (经纬度、海拔、遮蔽度等，其中遮蔽度使用