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湖泊沉积物的野外采集方法
Field Sampling Method of Lake Sediment
Authors:  胡婷朱立峰, 王建军 and date: 04/25/2021, view: 4312, Q&A: 0
确定采样地区沉积物的状态，如沉积物呈现稀泥状态，先尝试一下能否用重力柱状采泥器采集到样品，如不能则换其他方法采样。如果适合进行采样，则联系当地的渔民船只，确定租船时间和上船人数。 将沉积物柱与采样管分离的过程需要两到三人操作完成，首先“采样人员1”握着采泥器保持竖直状态，“采样人员2”将球形塞剥离并迅速将顶锤堵在采样管的下端管口，测量沉积物的柱长并记录。 沉积物采集过程 (a) 重力柱状采泥器；(b) 重力柱状采泥器 (未安装采样管)；(c) 安装好的采泥器准备放入湖水中；(d) 分割沉积物
沉积物、岩石样品总DNA提取
Total DNA Extraction from Sediment and Rock Samples
Authors:  牛明杨隋维康, 王风平 and date: 02/25/2021, view: 2794, Q&A: 0
如果第一次提取的DNA浓度达不到后续实验要求，可以进行二次提取，再将装有沉积物的小管加入600-700 μl提取缓冲液，用力将离心后的沉积物弹起，并且混匀，这一步可以参照步骤2，沉积物和缓冲液混合均匀后 (Zhou et al, 1996; Natarajan et al, 2016)在2 ml Ep管中加入0.3 g粒径为0.1 mm的玻璃砂，之后加入适量沉积物 (一般0.3 g~0.5 g湿重)； 加入650 μl的DNA抽提缓冲液，在打碎前需要将沉积物和缓冲液混匀，此步骤需在涡旋仪上安装水平离心管支
沉积物中溶解性有机质的提取
Extraction of Dissolve Organic Matter from Sediment Samples
Authors:  袁海军胡盎, 刘金福, 耿梦蝶, 刘勇勤, 王建军 and date: 01/12/2022, view: 9601, Q&A: 0
其中，称取一定量沉积物样品于带特氟龙盖子的棕色瓶，加入适量超纯水，通过超声震荡，使沉积物中DOM充分溶入水中。 沉积物中DOM提取的超声-固相萃取原理 实验步骤本实验大体流程如图2所示，详细步骤如下：充分混匀冷冻干燥后的样品，称取0.70 g沉积物于40 ml带特氟龙盖子的棕色瓶中。 在水生生态系统中，沉积物DOM主要来源于腐殖质、植物残体或凋落物、根系分泌物以及微生物生物量等。 每超声半小时需充分混匀溶液一次，至瓶底无沉积物依附后继续超声，共计超声4次。 基于Dittmar et al
海洋沉积物样品细胞提取及荧光显微镜计数法
Cell Extraction of Sediment Samples and Fluorescence Microscope Counting Method
Authors:  牛明杨贾泽宇, 王风平 and date: 07/07/2021, view: 3795, Q&A: 0
沉积物中部分杂质也会吸附荧光分子并呈现类似荧光信号，可以转换荧光信号到Tex red荧光通道,如果颗粒仍旧有红光，有可能是沉积物颗粒，而非细胞，应小心分辨。观察并拍照，保存合适的图片用于细胞计数。 二、样品处理取一定体积的沉积物样品，用沉积物细胞固定液，以1:5 (体积比例，样品1体积，固定液5体积) 的比例稀释并固定样品，用涡旋仪 (Vortex) 混匀；4 °C保存20 min，然后取100 这会阻碍我们对沉积物中微生物多样性和生态功能的研究。本方法主要利用化学试剂溶解颗粒物，并结合超声破碎和密度梯度
河口水体和沉积物中微生物的分离培养与鉴定
Isolation and Identification of Microorganisms in Estuarine Water Column and Sediments
Authors:  段丽王攀登, 李佳岭, 李文均 and date: 06/11/2021, view: 3262, Q&A: 0
水样稀释： 与沉积物样品稀释类似，将样品充分摇匀后梯度稀释至离心管中即可。 沉积物样品稀释：1)待培养基和样品风干完成后，首先将样品研磨至无明显大颗粒物，每个样品称取2 g放入锥形瓶中，放入28 °C振荡培养箱中振荡1 h左右。 稀释梯度：10-2、10-3 、10-4，共M个3)培养基：共X个 a)1/10 R2A' (额外添加2%海盐)b)1/20 MA4)样品盐度：2%-3%5)培养温度：28 °C样品预处理： 对于沉积物样品 锥形瓶超净工作台高温高压灭菌锅恒温震荡箱PCR仪离心机电泳仪软件和数据库EzBioCloud ( h
基于PacBio SMRT三代测序的红树林沉积物真菌群落的研究
Analysis of Fungal Community in Mangrove Sediments Based on PacBio SMRT Sequencing
Authors:  张志峰李猛 and date: 04/23/2021, view: 3292, Q&A: 0
红树林样品的采集使用特制的沉积物样品采样器，沉积物样品的采集使用三点或五点取样法。对每个样点的3-5个重复样品进行等量混合以减少采样偏差。根据实验需要可对样品按深度分层，使用无菌自封袋保存。 number: R050) 或 Phusion High-Fidelity DNA Polymerase (Thermo Scientific, catalog number: