Improve Research Reproducibility
A Bio-protocol resource
实验方案
研究领域
癌症生物学 (450)
发育生物学 (339)
分子生物学 (1201)
干细胞 (269)
免疫学 (620)
神经科学 (740)
生物化学 (1444)
生物物理学 (183)
微生物学 (1193)
系统生物学 (359)
细胞生物学 (2243)
植物科学 (1098)
Bio-protocol
期刊
Bio-101 实验手册
课题组实验方案合辑
Request a Protocol
作者指南
关于
提交实验方案
订阅
A high-quality database for basic life science protocols
实验方案
研究领域
癌症生物学 (450)
发育生物学 (339)
分子生物学 (1201)
干细胞 (269)
免疫学 (620)
神经科学 (740)
生物化学 (1444)
生物物理学 (183)
微生物学 (1193)
系统生物学 (359)
细胞生物学 (2243)
植物科学 (1098)
Bio-protocol 期刊
Bio-101 实验手册
课题组实验方案合辑
Request a Protocol
订阅
提交
提交实验方案
作者指南
关于
真菌多样性的搜索结果
Peer-reviewed
Preprint
Extracted from published research articles
生物化学
生物信息学与计算生物学
生物物理学
癌症生物学
细胞生物学
发育生物学
免疫学
微生物学
分子生物学
神经科学
植物科学
干细胞
系统生物学
研究物种
节肢动物
鱼类
真菌
无脊椎动物
哺乳纲
其它脊椎动物
植物
原核生物
原生动物
病毒
蠕虫
相关性
日期
浏览量
基于高通量测序技术的丛枝菌根真菌多样性研究方法
High-throughput Sequencing-based Method for Characterizing Biodiversity of Arbuscular Mycorrhizal Fungi
Authors:
付伟
武慧
,
陈保冬
and
date:
04/22/2021,
view:
6546,
Q&A:
0
ITS是
真菌
多样性
研究的通用区域,其在AM
真菌
多样性
研究中的应用次之,但有逐渐增多的趋势。 下游的AM
真菌
多样性
分析可以从ASV水平和VT水平同时进行,分析方法与其他微生物类似,例如使用Vegan软件包绘制AM
真菌
ASV水平的稀释曲线并计算其α
多样性
。 AM
真菌
多样性
研究可用引物表1. AM
真菌
多样性
研究可用引物列表及其优缺点引物组合 优点 缺点 参考文献 AML1/AML2 AM
结构方程模型在土壤微生物生态学中的应用
Applications of Structure Equation Modeling (SEM) in Soil Microbial Ecology
Authors:
杨腾
褚海燕
and
date:
04/13/2021,
view:
7144,
Q&A:
0
... 实验步骤测试数据与理论模型 本文的测试数据来源先前对青藏高原高寒草地土壤
真菌
多样性
分布规律的研究(Yang et al.,2017),涉及60个100 × 100 m样地的地上植物
多样性
、土壤
真菌
多样性
(F.richness和P.richness)分别代表土壤
真菌
和地上植物的
多样性
。 此外,根据路径系数的加乘运算,我们以表格的形式展现出各因素对土壤
真菌
多样性
分布的总的、直接和间接作用(图13b)。 SEM路径图(
提取杨树人工林土壤微生物菌体细胞的4种方法
Four Methods to Eextract Soil Microbes from Poplar Plantation
Authors:
王科选
秦媛
,
潘雪玉
,
靳微
,
杨预展
,
袁志林
and
date:
04/23/2021,
view:
2612,
Q&A:
0
... 焦磷酸钠处理后所得细菌群落结构组成与原始土样最接近,且群落
多样性
较为丰富,均匀度较高;虽然其
真菌
组分中OTUs数量明显较少,但可培养
真菌
的数量却显著高于其他三个处理组,且FF
真菌
微平板分析中AWCD值反映了
真菌
菌群利用碳源能力 ;BIOLOG微平板分析表明其细菌、
真菌
菌群代谢活力、
多样性
指数和均匀度均在较低水平。 MES处理组所得细菌、
真菌
物种数量最大且
多样性
较丰富,但与原始土样微生物群落结构组成相差较大,且可培养细菌和
栎类外生菌根形态学特征描述
Morphological Description of Quercus Ectomycorrhizae
Authors:
王科选
靳微
,
杨预展
,
袁志林
and
date:
04/12/2021,
view:
3057,
Q&A:
0
... 弗吉尼亚栎母树林外生菌根的
真菌
多样性
. 林业科学56: 120-132.Agerer, R. (2012). Colour atlas of ectomycorrhizae. Volume 15. 在菌根横切面上观察到,哈蒂格网的结构表现为苗根表皮细胞间菌丝的细胞间延伸,皮层细胞内没有
真菌
定植。图6. 多种栎树一年生实生幼苗外生菌根横截面 A. 白栎 (Quercus
Marker Genes (16S and ITS) Protocol for Plant Microbiome Analyses
植物微生物组分析的标记基因(16S 和 ITS)实验方法
Author:
Geoff Zahn
date:
04/20/2022,
view:
1630,
Q&A:
0
... ASV 的优势包括发现
多样性
的潜力,否则这些
多样性
可能会通过将序列集中在一起而被掩盖,并实现完全可重复的结果 (Tipton et al ., 2022)。 ... 观察计数、香农和辛普森
多样性
测量的 Alpha
多样性
箱线图。 这使我们能够发现实验室环境中存在的 DNA
基于PacBio SMRT三代测序的红树林沉积物真菌群落的研究
Analysis of Fungal Community in Mangrove Sediments Based on PacBio SMRT Sequencing
Authors:
张志峰
李猛
and
date:
04/23/2021,
view:
3371,
Q&A:
0
四、 数据统计与分析 基于步骤三所获得的代表性序列和OTU table对
真菌
群落的α
多样性
、β
多样性
、生物地理学特征、分布与群落结构的影响因素,群落结构的组装过程、共现性关系等内容进行分析与可视化展示 最新版的UNITE数据库分为
真菌
和真核两种,
真菌
数据库主要为
真菌
序列,真核数据库主要为真核序列,真核数据库相比于
真菌
数据库更加全面准确,因而建议使用真核数据库。 有研究表明早期的UNITE数据库中有许多序列都是错误鉴定的,将一些非
真菌
生物鉴