资源利用网络的搜索结果

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根际细菌群落资源利用网络的研究方法
Calculation of Trophic Network of Rhizosphere Bacterial Community
Authors:  杨天杰张潞潞, Alexandre Jousset, 韦中 and date: 04/23/2021, view: 3533, Q&A: 0
营养网络模型计算原理示意图 注：红色表示病原菌（青枯菌）资源利用情况，黑色表示五株本地微生物的资源利用情况；方块填充表示该物种可利用相应资源，反之，无法利用。 微生物群落与青枯菌的资源竞争网络特征参数均由各菌株资源利用能力的结果计算而得 (详见“菌株的资源利用能力的检测”部分，图1A)。 用 R 3.1.2 (www.r-proje
利用Parallel-Meta Suite在多平台下进行交互式微生物组分析
Interactive Microbiome Data Analysis on Multiple Platforms Using Parallel-Meta Suite
Authors:  李坚陈俞竹, 苏晓泉 and date: 08/20/2022, view: 3226, Q&A: 0
在共现网络中，网络节点是群落特征（例如，一个微生物分类单元），网络的边代表节点间的Spearman相关性，然后计算网络密度、直径、半径和集中度来量化网络属性。 对于鸟枪法测序序列，利用隐式马尔可夫模型(Mistry等， 2013)识别和提取标记基因片段（如16S rRNA或18S rRNA基因）。 2)场景二：在本地使用配置向导进行参数配置，并在远程服务器上进行运算分析 大量样本（比如大于1,000）的处理和运算需要更长的时间和更多的计算资源，我们建议在更强大的服务器
野生动物微生物组数据平台构建的技术方法和实践挑战
Technical Frameworks and Practical Challenges in Developing Wildlife Microbiome Databases
Authors:  王恺毅杨蕊菁, 李雨霏, 赵李頔涵, 闫利平, 王海燕, 高云云 and date: 02/05/2026, view: 270, Q&A: 0
... 此外，biochem4j [34] 基于Neo4j图数据库，将分类学、酶、化学反应和化学物质等多种数据类型整合为互联的节点网络，并关联UniProt、KEGG、ChEBI等外部资源，支持跨领域的复杂查询与交互式网络展示 在这一过程中，数据层面的规范化和多样性保障了平台的科学价值，技术架构的分层与容器化则确保了可扩展性与稳定性，而前端交互和可视化的优化设计最终决定了研究者能否便捷高效地利用平台资源。 资源监控：通过Prometheus与Grafana搭建监控系统，实时跟踪CPU、内
斑马鱼原始生殖细胞移植或替换技术
Primordial Germ Cells Transplantation or Replacement in Zebrafish
Authors:  张峰华潘鲁湲, 王小四, 朱作言, 孙永华 and date: 03/08/2022, view: 5407, Q&A: 0
... 致谢国家斑马鱼资源中心得到科技部财政部国家科技资源共享服务平台；国家重点研发计划（2018YFA08010000）；中国科学院生物资源科技服务网络计划动物实验平台项目；湖北省自然科技资源库等项目的支持。 移植或替换，一方面可以实现品种改良，如将经济价值较高但养殖困难的鱼类PGC移植入经济价值一般但养殖简单的鱼类中；另一方面可以缩短繁殖周期，如将繁殖周期较长的鱼类PGC移植入繁殖周期较短的鱼类中；最后，利用该方法还可以实现珍稀种质资源的活体保藏 利用
物种树构建后的基因渗入检验方法
Methods of Detecting Introgression after Species-tree Construction
Authors:  丁颖纪繁迪, 黄华腾 and date: 02/10/2022, view: 9663, Q&A: 1
... 构建网络树比传统的系统发育树构建 (即构建物种分化的二叉树) 更为复杂。搜寻最优网络树不仅要优化二叉树的拓扑结构和枝长，还考虑杂交物种组合的各种可能。因此，构建网络树需要耗费更多的计算资源。 MCMC_GT中提供了利用伪似然值 (-pseudo) 的选项来加速计算。 计算资源的限制使得很多PhyloNet方法在超过10个类群和3个杂交节点的数据集上无法运行 (Yu and Nakhleh, 2015)，而且多数方法都需使用者指定最大杂交次数来限制搜索空间。 与BLT利用