高通量siRNA筛选技术的搜索结果

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高通量siRNA文库筛选体系的建立及优化
High-Throughput siRNA Library Screening Assay Development and Optimization
Author:  韩帅date: 10/22/2021, view: 4078, Q&A: 0
近些年随着CRISPR技术的快速发展，全基因组CRISPR筛选技术也开始被研究者越来越多地使用。siRNA筛选和CRISPR筛选两类技术各有优势。 综上所述，siRNA筛选技术和CRISPR技术将互相补充，相辅相成，成为功能基因组筛选领域并行的两大利器。 高通量siRNA文库筛选流程从具体操作步骤来讲，笔者单位开展正式高通量
siRNA文库转染条件优化方法
Optimization of siRNA Library Transfection
Authors:  田维新韩帅, 陈铭 and date: 10/22/2021, view: 3742, Q&A: 0
若筛选体系有已知的阳性基因，可根据阳性基因siRNA出现表型的时长确定筛选体系的时长。 反式转染是高通量siRNA筛选的主要转染方式，下文重点介绍反式转染的条件优化方法。 我们常用的siRNA转染试剂包括DharmaFECT及Lipofectamin RNAiMAX，均属于脂质体类转染试剂。每孔转染试剂的用量需要同时考虑转染效率、转染毒性及高通量筛选的成本。 对于高通量实验，反式转染是首选的转染方式，因为：1) 铺细
生物钟调控基因的高通量siRNA筛选
A high-throughput siRNA Screen for Circadian Clock Modulators
Authors:  李慧林欧家丽, 唐芸棋 and date: 06/01/2021, view: 2081, Q&A: 0
SD值为标准差；C.V值为离散系数，用于评估组内数据的离散程度；Z-factor也被称作Z-因子，用于评估筛选体系是否适合高通量筛选，Z-factor值介于0.5-1.0之间时，证明筛选体系适合进行高通量筛选 的制备1.1将siRNA库（Dharmacon, Mouse siGENOME siRNA Library, 申请于生物化学与细胞生物学研究所化学生物学技术平台）的384孔板室温放置10 min 后，水平离心机中 致谢感谢中国科
细胞周期调控因子筛选---FUCCI活细胞标记法
Screening for Cell Cycle Regulators-FUCCI Live Cells Labeling Method
Authors:  鲁家骏韩帅, 杨巍维 and date: 09/05/2021, view: 4447, Q&A: 1
感谢中科院生化与细胞所化学生物学技术平台在高通量siRNA文库筛选及高内涵成像分析实验中给予的帮助，感谢细胞分析技术平台在流式细胞实验中给予的帮助。 通常情况下，由于实验安排的限制，一般分好siRNA的384孔板都放于-80 °C冰箱保存，待正式筛选实验开始时，提前拿出恢复至室温。高浓度多聚甲醛会释放甲醛，请在通风橱内进行操作。 siRNA转染的具体操作步骤如下：阴阳性对照siRNA的制备：1.1使用1x siRNA
胃癌细胞中Hippo通路负调控因子筛选-YAP出入核检测
Screening of Negative Regulators of Hippo Pathway in Gastric Cancer Cells with Nuclear Translocation of YAP as Readout
Authors:  汤扬焦石, 周兆才 and date: 06/01/2021, view: 3322, Q&A: 0
YAP定位情况二、高通量筛选：选择Human ON-TARGETplus (OTP) siRNA亚文库：GPCR、Phosphatase和Protease等亚文库。 致谢感谢中国科学院分子细胞科学卓越中心化学生物学技术平台对本实验方法的帮助和改进。 2.7确定合适的筛选条件：选择视野中细胞分散且YAP定位于核内的筛选条件，如图2所示。 因此，在筛选前的细胞培养过程中，一直需要保持细胞密度低的情况，使得YAP在细胞核内，筛选过程中铺细胞后才不会影响实验结
全基因组siRNA法筛选长非编码RNA NEAT1的转录调控因子
Genome-wide siRNA Screen for Transcription Regulators of Long Noncoding RNA NEAT1
Authors:  王洋陈玲玲 and date: 07/07/2021, view: 2215, Q&A: 0
传统的外源性的小干扰RNA (small interference RNAs, siRNAs) 对于敲减目的基因的表达是非常有效的，全基因组siRNA文库可允许研究人员通过高通量的方式研究每个基因对特定细胞表型的影响 二、全基因组siRNA文库筛选 (图2)图 2. Human siGENOME SMARTpool siRNA library筛选NEAT1G-HeLa-R 流程。 NEAT1G-HeLa-R 筛选结果绿色荧光通道代表图及各孔信息。图 4. 筛选