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鉴定RNA结合蛋白靶标的CLIP-seq实验方案
CLIP-seq Protocol for Identifying in vivo Targets of RNA Binding Proteins
Authors:  陈庚阮雯, 马素平, 周宇 and date: 09/28/2022, view: 2696, Q&A: 0
进一步可对peaks进行基序（motif）分析，如使用Homer （http://homer.ucsd.edu/homer/motif/）等软件，鉴定结合位点中富集的motifs，可作为目的RNA结合蛋白的特异性 ，孵育20 min，以降解RNA-蛋白复合物中的蛋白质，将RNA释放到反应体系中。 八、抽提目的蛋白结合的RNA对照1:1K高浓度MNase消解样品的同位素信号，在DDX17 L bead