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野外树木根系取样及根际土收集操作规程
Protocol for Sampling of Root and Rhizosphere Soils from Trees in Natural Fields
Authors:  何兴华杨预展, 袁志林 and date: 03/25/2021, view: 6891, Q&A: 0
二、 根系取样建议选择具有代表性的土壤,一般随机选择健康的树木作为根际土取样目标。采样时建议使用五点取样法采集样品,即先确定对角线的中点作为中心取样点,而后在对角线上选择与中心点距离相等的点进行取样。 根际土分离流程注意事项:根系取样,时常会碰到杂质含量较高,取样时需要对杂质进行过滤,避免石块等杂质戳破采样袋等情况的发生,也会给后续提取造成干扰。 采样时每个采样点的取样深度及采样量应均匀一致。 或者使用等距离取样
Cas-16S-seq:利用CRISPR/Cas9靶向消除16S-seq中高丰度植物序列的方法
Cas-16S-seq: Using CRISPR/Cas9 to Eliminate Abundant Plant Sequences in 16S-seq
Authors:  宋露洋谢卡斌 and date: 04/13/2021, view: 2984, Q&A: 0
... 三、植物根系样品的分离和基因组DNA纯化水稻根系取样方法。戴上丁腈手套并利用75%医用酒精进行消毒,握住水稻嫩枝直接拔取种植在田间水稻全株根系,避免对根系组织造成损伤。 注:研磨钵和研磨棒以及液氮是主要污染来源,需要经过多次双蒸水清洗以及高温高压灭菌处理 (或酒精灼烧),防止细菌或残留植物组织污染,同时在整个取样根系清洗以及研磨的过程中均要设置空白对照组,监测试验过程中是否带入细菌污染 运回实验室的根系样品应迅速置于-20 °C (最好置于-
水稻根系微生物组研究中的样本种植、取样和16S rRNA 基因扩增子文库制备方法
Planting, Sample Collection and Library Preparation of 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing for Rice Root Microbiomes
Authors:  徐浩然张婧赢, 郭晓璇, 曲宝原, 刘永鑫, 白洋 and date: 04/27/2021, view: 4598, Q&A: 1
根系样本的收取 (图 2)。为了获得和水稻根系紧密联系的微生物数据,需要获得尽可能干净的根系样本。 使用无菌滤纸吸干根系残留水分。使用无菌剪刀将根系破碎成2 mm长的小段,此样本即为根系样本。 注:所有样本应置于无菌的离心管内于-80 °C环境保存。图2. 使用无菌镊子和剪刀在断层中挑取2至3个分蘖的全根剪下,于30 ml无菌去离子水中大力摇晃至根系表面附着的土壤颗粒脱落,使用无菌镊子挑出根系弃去。剩余液体于3,000 rpm条件下离心15 min。
小麦相关微生物的野外采样与样品保存
Field Sampling and Sample Storage of Wheat-associated Microbiomes
Authors:  马玉颖褚海燕 and date: 04/22/2021, view: 2684, Q&A: 0
... 提前将研磨机适配器放入液氮中预冷,再将准备好的离心管置于适配器中进行研磨,将其中的小麦组织样品粉碎成粉末状,用以提取样品DNA;参数组设定:研磨次数1次,频率40 Hz,运行时间60 s。 实验室中利用小毛刷 (提前灭菌) 将紧密附着在根系表面的土壤刷下来,尽量刷到根系表面无明显的土壤颗粒 (土壤和根系颜色一般有明显差异,可以通过颜色来辨别是否刷得较为干净了), 收集到10 ml无菌离心管中 将剩余小麦根系用无菌水冲洗干净,利用无菌滤纸吸取洗净的根表多余水分,置于新的样品密封袋中,再用液氮速冻,保
植物根际土壤样品的非破坏性连续采集
Nondestructive Continuous Collection of Plant Rhizosphere Soil
Authors:  付蕊欣谷益安, 韦中, 徐阳春 and date: 04/13/2021, view: 5349, Q&A: 0
... (B)中间取样层为若干个尼龙网袋(尼龙网孔径为150微米,高136毫米,宽18~21毫米,厚1~2毫米),包含均质、灭菌的田间土壤。中间层尼龙网袋土壤与植物根系根系分泌物接触密切,可作为根际土壤。 此外,如果采用传统破坏取样方式获得3株植株在5个生长发育时期的根际土壤,则需种植15株植株,而采用非破坏性取样方式则仅需3株植株,大大减少了人力、物力和财力投入。 根盒采样装置示意图(A、B)及根室中番茄植株根系实物图(C).(A)根盒由三层圆柱体组成,内层(根室)由50微米的尼龙网
A Simplified Hydroponic Culture of Arabidopsis
一种简单的拟南芥水培方法
Authors:  Houqing ZengChao Xia, Cankui Zhang, Li-Qing Chen and date: 12/20/2018, view: 12006, Q&A: 0
... 我们的系统还具有防止藻类生长,确保整个根系收获和保持植物高度均匀性的优点。在我们的水培系统中,植物可以健康地完成整个生命周期,并可根据研究目标在不同的生长阶段进行处理和取样。 该系统具有防止藻类生长和确保整个根系收获的一些优点。然而,制备一些材料相对复杂,例如50ml Falcon管的穿孔盖和两种不同的营养液(发芽溶液和基础生长溶液)。
杨树根系-真菌互作体系构建方法
Method for Constructing Poplar-root Fungus Interaction System
Authors:  何兴华单晓亮, 彭龙, 袁志林 and date: 04/12/2021, view: 2914, Q&A: 0
根据自身实验要求设计共培养时间,然后取样进行生理指标的测定。 注:大培养皿体系主要目的是用于直观的观测根系内生菌对树木根系的促生作用,而大试管体系的目的是使根系内生菌完全侵染根系后可用于盆栽试验 (耐盐、耐旱等)。图1. 将步骤二挑选的根系和株高较为均一的杨树无菌幼苗用镊子轻轻取出,放入装有无菌水的玻璃大培养皿中,小心洗除根部的琼脂,并用无菌滤纸吸干表面水份后,转接至大试管共培养培养基表面,并使无菌苗根系贴附于共培养培养基表面 然后选取根系大小、发达程
枫香-真菌互作培养体系构建
Method for Constructing Liquidambar Styraciflua, Root Fungus Interaction System
Authors:  王玉宸彭龙, 潘雪玉, 袁志林 and date: 04/23/2021, view: 2732, Q&A: 0
... 而后,转移至光照培养箱中以相同条件继续培养,根据自身实验要求设计共培养时间,然后取样进行生理指标的测定。 而后,转移至光照培养箱中以相同条件继续培养,根据自身实验要求设计共培养时间,然后取样进行生理指标的测定。图3. 枫香-真菌共培养体系示意图. 2.6选取根系大小、发达程度和株高较一致 (5-6 cm) 的无菌幼苗,进行共培养。 沿海防护林树种促生、耐盐根系真菌筛选及机制初探. 硕士学位论文. 中国林业科学研究院.