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野外树木根系取样及根际土收集操作规程
Protocol for Sampling of Root and Rhizosphere Soils from Trees in Natural Fields
Authors:
何兴华
杨预展
,
袁志林
and
date:
03/25/2021,
view:
6891,
Q&A:
0
二、
根系
取样
建议选择具有代表性的土壤,一般随机选择健康的树木作为根际土
取样
目标。采样时建议使用五点
取样
法采集样品,即先确定对角线的中点作为中心
取样
点,而后在对角线上选择与中心点距离相等的点进行
取样
。 根际土分离流程注意事项:
根系
取样
,时常会碰到杂质含量较高,
取样
时需要对杂质进行过滤,避免石块等杂质戳破采样袋等情况的发生,也会给后续提取造成干扰。 采样时每个采样点的
取样
深度及采样量应均匀一致。 或者使用等距离
取样
Cas-16S-seq:利用CRISPR/Cas9靶向消除16S-seq中高丰度植物序列的方法
Cas-16S-seq: Using CRISPR/Cas9 to Eliminate Abundant Plant Sequences in 16S-seq
Authors:
宋露洋
谢卡斌
and
date:
04/13/2021,
view:
2984,
Q&A:
0
... 三、植物
根系
样品的分离和基因组DNA纯化水稻
根系
取样
方法。戴上丁腈手套并利用75%医用酒精进行消毒,握住水稻嫩枝直接拔取种植在田间水稻全株
根系
,避免对
根系
组织造成损伤。 注:研磨钵和研磨棒以及液氮是主要污染来源,需要经过多次双蒸水清洗以及高温高压灭菌处理 (或酒精灼烧),防止细菌或残留植物组织污染,同时在整个
取样
,
根系
清洗以及研磨的过程中均要设置空白对照组,监测试验过程中是否带入细菌污染 运回实验室的
根系
样品应迅速置于-20 °C (最好置于-
水稻根系微生物组研究中的样本种植、取样和16S rRNA 基因扩增子文库制备方法
Planting, Sample Collection and Library Preparation of 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing for Rice Root Microbiomes
Authors:
徐浩然
张婧赢
,
郭晓璇
,
曲宝原
,
刘永鑫
,
白洋
and
date:
04/27/2021,
view:
4598,
Q&A:
1
根系
样本的收取 (图 2)。为了获得和水稻
根系
紧密联系的微生物数据,需要获得尽可能干净的
根系
样本。 使用无菌滤纸吸干
根系
残留水分。使用无菌剪刀将
根系
破碎成2 mm长的小段,此样本即为
根系
样本。 注:所有样本应置于无菌的离心管内于-80 °C环境保存。图2. 使用无菌镊子和剪刀在断层中挑取2至3个分蘖的全根剪下,于30 ml无菌去离子水中大力摇晃至
根系
表面附着的土壤颗粒脱落,使用无菌镊子挑出
根系
弃去。剩余液体于3,000 rpm条件下离心15 min。
小麦相关微生物的野外采样与样品保存
Field Sampling and Sample Storage of Wheat-associated Microbiomes
Authors:
马玉颖
褚海燕
and
date:
04/22/2021,
view:
2684,
Q&A:
0
... 提前将研磨机适配器放入液氮中预冷,再将准备好的离心管置于适配器中进行研磨,将其中的小麦组织样品粉碎成粉末状,用以提
取样
品DNA;参数组设定:研磨次数1次,频率40 Hz,运行时间60 s。 实验室中利用小毛刷 (提前灭菌) 将紧密附着在
根系
表面的土壤刷下来,尽量刷到
根系
表面无明显的土壤颗粒 (土壤和
根系
颜色一般有明显差异,可以通过颜色来辨别是否刷得较为干净了), 收集到10 ml无菌离心管中 将剩余小麦
根系
用无菌水冲洗干净,利用无菌滤纸吸取洗净的根表多余水分,置于新的样品密封袋中,再用液氮速冻,保
植物根际土壤样品的非破坏性连续采集
Nondestructive Continuous Collection of Plant Rhizosphere Soil
Authors:
付蕊欣
谷益安
,
韦中
,
徐阳春
and
date:
04/13/2021,
view:
5349,
Q&A:
0
... (B)中间
取样
层为若干个尼龙网袋(尼龙网孔径为150微米,高136毫米,宽18~21毫米,厚1~2毫米),包含均质、灭菌的田间土壤。中间层尼龙网袋土壤与植物
根系
及
根系
分泌物接触密切,可作为根际土壤。 此外,如果采用传统破坏
取样
方式获得3株植株在5个生长发育时期的根际土壤,则需种植15株植株,而采用非破坏性
取样
方式则仅需3株植株,大大减少了人力、物力和财力投入。 根盒采样装置示意图(A、B)及根室中番茄植株
根系
实物图(C).(A)根盒由三层圆柱体组成,内层(根室)由50微米的尼龙网
A Simplified Hydroponic Culture of
Arabidopsis
一种简单的拟南芥水培方法
Authors:
Houqing Zeng
Chao Xia
,
Cankui Zhang
,
Li-Qing Chen
and
date:
12/20/2018,
view:
12006,
Q&A:
0
... 我们的系统还具有防止藻类生长,确保整个
根系
收获和保持植物高度均匀性的优点。在我们的水培系统中,植物可以健康地完成整个生命周期,并可根据研究目标在不同的生长阶段进行处理和
取样
。 该系统具有防止藻类生长和确保整个
根系
收获的一些优点。然而,制备一些材料相对复杂,例如50ml Falcon管的穿孔盖和两种不同的营养液(发芽溶液和基础生长溶液)。
杨树根系-真菌互作体系构建方法
Method for Constructing Poplar-root Fungus Interaction System
Authors:
何兴华
单晓亮
,
彭龙
,
袁志林
and
date:
04/12/2021,
view:
2914,
Q&A:
0
根据自身实验要求设计共培养时间,然后
取样
进行生理指标的测定。 注:大培养皿体系主要目的是用于直观的观测
根系
内生菌对树木
根系
的促生作用,而大试管体系的目的是使
根系
内生菌完全侵染
根系
后可用于盆栽试验 (耐盐、耐旱等)。图1. 将步骤二挑选的
根系
和株高较为均一的杨树无菌幼苗用镊子轻轻取出,放入装有无菌水的玻璃大培养皿中,小心洗除根部的琼脂,并用无菌滤纸吸干表面水份后,转接至大试管共培养培养基表面,并使无菌苗
根系
贴附于共培养培养基表面 然后选取
根系
大小、发达程
枫香-真菌互作培养体系构建
Method for Constructing
Liquidambar Styraciflua
, Root Fungus Interaction System
Authors:
王玉宸
彭龙
,
潘雪玉
,
袁志林
and
date:
04/23/2021,
view:
2732,
Q&A:
0
... 而后,转移至光照培养箱中以相同条件继续培养,根据自身实验要求设计共培养时间,然后
取样
进行生理指标的测定。 而后,转移至光照培养箱中以相同条件继续培养,根据自身实验要求设计共培养时间,然后
取样
进行生理指标的测定。图3. 枫香-真菌共培养体系示意图. 2.6选取
根系
大小、发达程度和株高较一致 (5-6 cm) 的无菌幼苗,进行共培养。 沿海防护林树种促生、耐盐
根系
真菌筛选及机制初探. 硕士学位论文. 中国林业科学研究院.