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植物
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蠕虫
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高通量siRNA文库筛选体系的建立及优化
High-Throughput siRNA Library Screening Assay Development and Optimization
Author:
韩帅
date:
10/22/2021,
view:
3913,
Q&A:
0
二、
建立
siRNA
筛选
检测
体系
需要考虑的重点因素siRNA
筛选
体系
建立
的目标及指导原则 所有高通量
筛选
项目在
体系
建立
及优化阶段基本都围绕共同的目标,即
筛选
体系
的特异性、灵敏性及稳定性。 在开始正式
筛选
之前,每个项目都经过了
筛选
体系
的
建立
及优化。本文将重点介绍siRNA
筛选
体系
建立
siRNA文库筛选细胞活力调控因子---CellTiter-Glo法
siRNA Library Screening of Regulatory Factors of Cell Viability—CellTiter-Glo Luminescent Cell Viability Assay
Authors:
陈敏
骆大葵
,
韩帅
,
李心翔
,
高大明
and
date:
06/01/2021,
view:
3222,
Q&A:
0
筛选
体系
建立
及优化 为
建立
最优的
筛选
实验
体系
,我们测试并优化了多种实验条件,主要包括:细胞接种密度、CTG检测阈值、CTG用量、siRNA转染试剂及用量。
筛选
出候选基因后,后续再用其他实验辅助验证。 正式
筛选
实验时,每块siRNA板子都需要设置阴性和阳性对照,数据处理时都是跟同一块板的阴性对照NC比较。 运用96孔板进行
筛选
实验,液体体积在150-200 μl均可。由于ATP易水解,加入CTG试剂的整个检测实验操作过程中应该特别注意
利用SPR技术高通量筛选蛋白互作活性小分子
High-Throughput Screening for Small Molecules Interacting with Targeted Protein by SPR Technology
Authors:
刘伟
谢华彬
,
王烁英
,
慈云青
,
许超
,
兰姝珏
,
陈铭
and
date:
03/06/2025,
view:
1828,
Q&A:
0
(德国Nano Temper公司)离心机Centrifuge 5810R(德国Eppendorf公司)微孔板振荡器ORBITAL SHAKER MX100-4A(CHINCAN公司)实验步骤一、高通量
筛选
体系
的
建立
和
筛选
实施高通量
筛选
总流程 本案例中高通量
筛选
实验设计、系统
建立
以及
筛选
实施均由中国科学院分子细胞科学卓越创新中心化学生物学技术平台完成。感谢化学平台各位老师在项目实施过程中所提供的帮助。参考文献李杰. (2022). 相比其它分子互作
荧光偏振技术在β-catenin/LEF1相互作用小分子抑制剂高通量筛选中的应用
Application of A Fluorescence Polarization Screening Assay for the Discovery of β-catenin/LEF1 Interaction Antagonists
Authors:
闫干干
戚海燕
,
付正豪
,
陈云雨
and
date:
06/24/2021,
view:
3891,
Q&A:
0
荧光偏振
筛选
模型Z′因子值的确定苗头化合物的
筛选
应用上述已
建立
的荧光偏振高通量
筛选
模型,对本室天然产物化合物库进行了高通量
筛选
,成功
筛选
到血根碱 (sanguinarine, SAN) 和白屈菜红碱 溶液配方重组人β-catenin 重组人β-catenin由大肠杆菌原核表达,经分离纯化后制备,用于荧光偏振
筛选
模型的
建立
。 β-catenin最佳工作浓度确定是高通量
筛选
模型
建立
的关键要素。通常认为参与反应的β-ca
hcGAS特异性小分子抑制剂体外高通量筛选
High-throughput Screening of Human cGAS Specific Small Molecule Inhibitors
in Vitro
Authors:
侯燕飞
杨银龙
,
张从刚
and
date:
10/22/2021,
view:
1910,
Q&A:
0
同时,我们提纯了Luciferase蛋白并
建立
了ATP-LUM检测
体系
(Nakatsu et al., 2006),为体外高通量
筛选
的检测提供了便捷的实验方法。 二、cGAMP合成
体系
与ATP-LUM检测
体系
的
建立
在反应缓冲液中加入hcGAS、HT-DNA (一种双链DNA)、ATP和GTP,使其终浓度分别为100 nM、25 nM、100 μM和100 μM, 2019),前期cGAMP体外实验的成功合成,为后期体外高通量
筛选
反应
体系
提供了实验基础
AFLP基因组捕获技术: 一种通用的低阶元的系统发育分析方法
AFLP Genome Capture Technique: A General Method for Shallow Scale Phylogenetic Analysis
Authors:
李佳璇
梁丹
,
张鹏
and
date:
02/10/2021,
view:
3345,
Q&A:
0
... 接头连接和片段
筛选
(耗时:约1.5 h)2.1在新的0.2 ml离心管中,按下表
建立
接头连接反应
体系
(表2)。表2. 1.2按下表
建立
酶切反应
体系
(表1)。表1. 酶切反应
体系
1.3将配制好的酶切反应
体系
充分涡旋混匀,简短离心,37 °C孵育20 min。 1.3在新的0.2 ml离心管中,按下表
建立
探针文库混合
体系
(表10)。表10. 1.2按下表
建立
片段化反应
体系
(表8)。表8
基于表面等离子共振技术构建色氨酰tRNA合成酶的抑制剂筛选和验证体系
Establishment of Inhibitor Screening and Validation System for Tryptophanyl tRNA Synthetase Using Surface Plasmon Resonance
Authors:
王倩
朱贵旺
,
刘振明
and
date:
11/08/2024,
view:
777,
Q&A:
0
六、SA芯片固定His-avitag (biotin)-TrpRS,构建TrpRS与吲哚霉素在HBS-P缓冲溶液条件下的高通量
筛选
体系
为了测试TrpRS SPR分析系统在高通量
筛选
中的可行性和重复性, 数据的导出 实验注意要点成功经验 (1)标签和固定方式的优化:本次研究通过多次实验优化了TrpRS的标签和芯片固定方式,使SPR
体系
在高通量
筛选
中的适应性和灵敏度显著提高,Z因子数值稳定在0.9以上。 实验条件中,对TrpRS的亲和力结果图六、SA芯片固定His-avitag (biotin)-TrpRS
混合分子标记扩增子高通量测序方案
A Mixed Molecular Marker Amplicon Sequencing Scheme Based on High Throughput Sequencing Platform
Authors:
李佳璇
张圆
,
梁丹
,
张鹏
and
date:
01/25/2021,
view:
5212,
Q&A:
0
... 第一轮PCR: 按下表
建立
20 μl的反应
体系
:PCR反应程序: 第二轮PCR: 按下表
建立
20 μl的反应
体系
:PCR反应程序: 使用1.2 %的琼脂糖凝胶电泳检测二轮PCR扩增产物 (如图2b)。 按下表
建立
片段化反应
体系
: 注: 建议片段化
体系
的准备工作在冰上完成。将配制好的酶切反应
体系
充分振荡混匀,离心,放入PCR仪中,37°C孵育10-25 min。 2)按下表
建立
平末端加A尾的反应
体系
:3)充分振
酶联免疫吸附实验在β-catenin/TCF4相互作用小分子抑制剂高通量筛选中的应用
Application of An Enzyme-linked Immunosorbent Assay for the Screening of Small-molecule Inhibitors Targeting β-catenin/TCF4 Interaction
Authors:
付正豪
戚海燕
,
闫干干
,
刘晓平
,
陈云雨
and
date:
07/07/2021,
view:
1793,
Q&A:
0
DMSO浓度对GST-TCF4 βBD/β-catenin结合反应的影响ELISA
筛选
模型Z′因子值的确定
建立
的ELISA
筛选
模型的Z′因子值为0.83,满足了高通量
筛选
中Z′因子值大于0.5 的基本要求 基于β-catenin/Lef1相互作用为靶标的新型抗肿瘤药物高通量
筛选
模型的
建立
. normal;">生物工程学报, 35(4): 707-717. 将GST-TCF4 βBD (2 μg/ml) 以100 μl/孔包被于96孔酶标板中,以100 μl/孔加入0.5