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Maize Genome Assembly with PacBio Reads
利用PacBio Reads组装玉米基因组
Authors:  Ying HuMarcio F. R. Resende Jr. and date: 07/05/2022, view: 1019, Q&A: 0
... 从那时起,PacBio 和 Oxford Nanopore 等长读长测序技术极大地促进了玉米基因组组装的改进。 与 Illumina 短读长相比,PacBio
基于高通量测序的全长DNA条形码获取方法
Methods for Obtaining Full-length DNA Barcodes Using High-throughput Sequencing
Authors:  杨琛涛周程冉, 刘山林, 周欣 and date: 08/25/2021, view: 5284, Q&A: 0
3.2HIFI-Barcode-PacBio PacBio测序。选取一份扩增产物混合液进行PacBio RSII平台质量检测、建库与测序,数据量约2-5 Gb。 HIFI-barcode-pacbio,适用于Pacbio测序平台https://github.com/comery/HIFI-barcode-pacbio。 基于三代测序数据的条形码获取- HIFI-Barcode-PacBio 三代
An Analysis Pipeline for Identification of RNA Modification, Alternative Splicing and Polyadenylation Using Third Generation Sequencing
使用第三代测序鉴定 RNA 修饰、可变剪接和多聚腺苷酸化的分析流程
Authors:  Yuxiang LiufuXuqing Liu, Lin Wu, Hangxiao Zhang, Yubang Gao, Lianfeng Gu and date: 06/05/2022, view: 1388, Q&A: 0
... [摘要]基于 Oxford Nanopore Technologies (ONT) 和 Pacific 的纳米孔测序 BioSciences (PacBio) 单分子实时 (SMRT) 长读长异构体测序 ... PacBio 测序及其应用。 基因组学蛋白质组学生物信息学13(5):278-289。17. Salmela , L. 和 Rivals, E. (2014)。
内生镰刀菌基因组染色体级别组装和注释
Chromosome-Scale Genome Assembly and Annotation Method of Endophyte Fusarium
Authors:  单晓亮袁志林 and date: 06/01/2021, view: 3280, Q&A: 0
... Illumina和PacBio测序流程图图1展示了第二代测序Illumina和第三代测序PacBio技术的测序流程,结合二代和三代测序数据进行了高质量的基因组组装。图 2. 对PacBio文库,构建每个菌株的20 kb插入片段大小的标准SMRTbell文库,用PacBio Sequel II系统对PacBio长读序列进行测序。 .,2018)仪器设备三代测序仪 (Pacif
基于DNA宏条形码的水体浮游细菌群落测序建库方法
Library Construction for DNA Metabarcoding of Bacterioplankton Communities in Waters
Authors:  肖鹏续子杰, 杨军 and date: 04/27/2021, view: 2384, Q&A: 0
小于580 bp,建议选用二代 Illumina PE300测序;如果PCR产物大于580 bp,建议选用三代PacBio测序。 DNA测序策略 根据PCR产物 (目标DNA片段) 的大小,选择合适的测序策略进行高通量测序。 如果DNA片段全长小于280 bp,选用二代Illumina PE150测 序;如果DNA片段大于280 bp、小于480 bp,选用二代Illumina PE250测序;如果DNA片段大于480 bp 浮游细菌群落建库测序中所用
基于PacBio SMRT三代测序的红树林沉积物真菌群落的研究
Analysis of Fungal Community in Mangrove Sediments Based on PacBio SMRT Sequencing
Authors:  张志峰李猛 and date: 04/23/2021, view: 3308, Q&A: 0
使用Enzyme Clean Up Kit对测序文库进行纯化。将测序引物退火结合至PCR产物文库,并将DNA 聚合酶结合测序模板。测序使用PacBio Sequal平台进行。 PacBio SMRT测序 此步骤主要由测序公司完成,简单步骤如下:将加有barcode的PCR产物按照预先设计的混样方案等量混合,然后将发卡测序接头连接到PCR文库并完成环化。 三、 数据分析CCS (circular consensus se