Improve Research Reproducibility
A Bio-protocol resource
实验方法
研究领域
癌症生物学 (441)
发育生物学 (333)
分子生物学 (1177)
干细胞 (258)
免疫学 (609)
神经科学 (725)
生物化学 (1419)
生物物理学 (177)
微生物学 (1179)
系统生物学 (353)
细胞生物学 (2194)
植物科学 (1082)
Bio-protocol
期刊
Bio-101 实验手册
课题组实验方法合辑
Request a Protocol
作者指南
关于
提交实验方法
订阅
A high-quality database for basic life science protocols
实验方法
研究领域
癌症生物学 (441)
发育生物学 (333)
分子生物学 (1177)
干细胞 (258)
免疫学 (609)
神经科学 (725)
生物化学 (1419)
生物物理学 (177)
微生物学 (1179)
系统生物学 (353)
细胞生物学 (2194)
植物科学 (1082)
Bio-protocol 期刊
Bio-101 实验手册
课题组实验方法合辑
Request a Protocol
订阅
提交
提交实验方法
作者指南
关于
Peer-reviewed
Preprint
Extracted from published research articles
生物化学
生物信息学与计算生物学
生物物理学
癌症生物学
细胞生物学
发育生物学
免疫学
微生物学
分子生物学
神经科学
植物科学
干细胞
系统生物学
研究物种
节肢动物
鱼类
真菌
无脊椎动物
哺乳纲
其它脊椎动物
植物
原核生物
原生动物
病毒
蠕虫
相关性
日期
浏览量
Maize Genome Assembly with PacBio Reads
利用PacBio Reads组装玉米基因组
Authors:
Ying Hu
Marcio F. R. Resende Jr.
and
date:
07/05/2022,
view:
1019,
Q&A:
0
... 从那时起,
PacBio
和 Oxford Nanopore 等长读长
测序
技术极大地促进了玉米基因组组装的改进。 与 Illumina 短读长相比,
PacBio
基于高通量测序的全长DNA条形码获取方法
Methods for Obtaining Full-length DNA Barcodes Using High-throughput Sequencing
Authors:
杨琛涛
周程冉
,
刘山林
,
周欣
and
date:
08/25/2021,
view:
5284,
Q&A:
0
3.2HIFI-Barcode-
PacBio
PacBio
测序
。选取一份扩增产物混合液进行
PacBio
RSII平台质量检测、建库与
测序
,数据量约2-5 Gb。 HIFI-barcode-
pacbio
,适用于
Pacbio
测序
平台https://github.com/comery/HIFI-barcode-
pacbio
。 基于三代
测序
数据的条形码获取- HIFI-Barcode-
PacBio
三代
An Analysis Pipeline for Identification of RNA Modification, Alternative Splicing and Polyadenylation Using Third Generation Sequencing
使用第三代测序鉴定 RNA 修饰、可变剪接和多聚腺苷酸化的分析流程
Authors:
Yuxiang Liufu
Xuqing Liu
,
Lin Wu
,
Hangxiao Zhang
,
Yubang Gao
,
Lianfeng Gu
and
date:
06/05/2022,
view:
1388,
Q&A:
0
... [摘要]基于 Oxford Nanopore Technologies (ONT) 和 Pacific 的纳米孔
测序
BioSciences (
PacBio
) 单分子实时 (SMRT) 长读长异构体
测序
...
PacBio
测序
及其应用。 基因组学蛋白质组学生物信息学13(5):278-289。17. Salmela , L. 和 Rivals, E. (2014)。
内生镰刀菌基因组染色体级别组装和注释
Chromosome-Scale Genome Assembly and Annotation Method of Endophyte
Fusarium
Authors:
单晓亮
袁志林
and
date:
06/01/2021,
view:
3280,
Q&A:
0
... Illumina和
PacBio
测序
流程图图1展示了第二代
测序
Illumina和第三代
测序
PacBio
技术的
测序
流程,结合二代和三代
测序
数据进行了高质量的基因组组装。图 2. 对
PacBio
文库,构建每个菌株的20 kb插入片段大小的标准SMRTbell文库,用
PacBio
Sequel II系统对
PacBio
长读序列进行
测序
。 .,2018)仪器设备三代
测序
仪 (Pacif
基于DNA宏条形码的水体浮游细菌群落测序建库方法
Library Construction for DNA Metabarcoding of Bacterioplankton Communities in Waters
Authors:
肖鹏
续子杰
,
杨军
and
date:
04/27/2021,
view:
2384,
Q&A:
0
小于580 bp,建议选用二代 Illumina PE300
测序
;如果PCR产物大于580 bp,建议选用三代
PacBio
测序
。 DNA
测序
策略 根据PCR产物 (目标DNA片段) 的大小,选择合适的
测序
策略进行高通量
测序
。 如果DNA片段全长小于280 bp,选用二代Illumina PE150测 序;如果DNA片段大于280 bp、小于480 bp,选用二代Illumina PE250
测序
;如果DNA片段大于480 bp 浮游细菌群落建库
测序
中所用
基于PacBio SMRT三代测序的红树林沉积物真菌群落的研究
Analysis of Fungal Community in Mangrove Sediments Based on PacBio SMRT Sequencing
Authors:
张志峰
李猛
and
date:
04/23/2021,
view:
3308,
Q&A:
0
使用Enzyme Clean Up Kit对
测序
文库进行纯化。将
测序
引物退火结合至PCR产物文库,并将DNA 聚合酶结合
测序
模板。
测序
使用
PacBio
Sequal平台进行。
PacBio
SMRT
测序
此步骤主要由
测序
公司完成,简单步骤如下:将加有barcode的PCR产物按照预先设计的混样方案等量混合,然后将发卡
测序
接头连接到PCR文库并完成环化。 三、 数据分析CCS (circular consensus se