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细胞RNA Pulldown实验——利用体外合成带生物素标记的RNA检测细胞裂解液中与目标RNA互作的蛋白的方法
RNA Pulldown Assay
Authors:  桑凌杰瞿蕾, 陈怡君, 林爱福 and date: 09/15/2022, view: 2074, Q&A: 0
RNA-蛋白孵育：5.1取预清洗好的包含有1mg蛋白的细胞裂解液各1 mg于两个新1.5 ml EP管中，加2 μl RNase Inhibitor，再分别加2 μg Biotin 标记的正义及反义对照 8.2如用于质谱蛋白组检测，增加细胞至10盘 (10 cm 细胞培养皿)，Biotin-RNA 正义/反义 各10 μg，streptavidin-beads 各100 μl。 C煮样5-10 min，用于后 续Western Blot检测目标蛋白。 在操作过程中要注意穿戴好干净的口罩、
利用体外合成带生物素标记的RNA富集细胞裂解液 中与之互作的蛋白的方法
A Method for Purifying RNA Interacting Proteins from Cell Lysates by Using in vitro Synthesized Biotin-labeled RNA
Authors:  朱林王会丽, 王栋 and date: 09/27/2022, view: 1858, Q&A: 0
研究背景随着对RNA功能研究的深入，人们发现许多RNA通过结合特定的蛋白质并影响其结构和功能来发挥作用。所以，鉴定RNA结合蛋白能够帮助我们更好地研究RNA的功能。 而RNA与靶蛋白质的相互作用时，很大程度上依赖于RNA的正确的结构状态，所以在进行RNA与蛋白孵育前，须先经过RNA复性这一步。 四、 Western blot实验验证RNA与蛋白质
利用RNA免疫共沉淀以及RT-qPCR实验验证MDA-MB-231-LM2细胞中LDHA蛋白与非编码RNA LINC00973的相互作用
Detecting the Interaction between non-coding RNA LINC00973 and LDHA Protein in MDA-MB-231-LM2 Cells by RNA Immunoprecipitation and RT-qPCR
Authors:  朱林王会丽, 王栋 and date: 09/27/2022, view: 1637, Q&A: 0
相比于其他基于蛋白去鉴定互作RNA的技术，如CLIP-seq等，RIP实验具有实验流程短、操作简便易上手、花费少等优点，是我们研究蛋白质与RNA互作常用的技术。 通过靶蛋白的特异性抗体，我们可以将结合在靶蛋白上的RNA与靶蛋白和抗体一同沉淀下来。之后收集沉淀物，再消化去除蛋白质，便可得到靶蛋白结合的RNA。 研究背景随着对
剪接因子SRSF7和mRNA的相互作用测试
The Interaction Detection between Serine/arginine-rich Splicing Factor 7 and mRNA
Authors:  侯敬丽陈红 and date: 05/15/2024, view: 874, Q&A: 0
... SPR检测技术具有实时检测、高效快速、亲和力测试动态范围宽等特点，可以获得RNA与蛋白之间亲和力常数等全面的互作信息。 运行结束后，结果表明（1）ssRNA或ssRNA-m6A和500nM SRSF7蛋白互作时的结合响应满足测试需求，因此用500 nM SRSF7蛋白2倍梯度稀释，共9个浓度点。 图1 Biacore 8k检测SRSF7蛋白与ssRNA和ssRNA-m6A互作的亲和力和动力学
水稻根系互作功能微生物的筛选方法
Screening Method of Functional Microorganisms Interacting with Rice Roots
Authors:  赵金彤刘晓青, 韩东飞, 伍宁丰, 田健 and date: 04/27/2021, view: 3797, Q&A: 0
水稻功能内生微生物的筛选及其与水稻互作降低镉胁迫效应的研究. 暨南大学.Andrews, J. M. (2001). 功能微生物提高水稻抗镉胁迫能力的应用4.1组培管实验 使用组培管进行水稻幼苗的培养，实验周期为14 d左右，可以在较短时间内高通量地初步筛选与水稻根系互作后部分解除镉胁迫的菌株 (Jan et al. 可确定其菌属相似性) 来分析菌株的菌属类别，根据农业农村部微生物肥料和食用菌菌种质量监督检验测试中心公布的《菌种安全等级调整目录及依据》，选择评定等级为1级 (免做毒理学试验) 的安全菌株进行水稻与微生物
2021年–2023年《Nature》&《Science》&《Cell》期刊论文中SPR技术应用统计
Overview of the Application of SPR Technology in Nature, Science and Cell Journal Publications from 2021 to 2023
Authors:  刘伟兰姝珏, 陈铭 and date: 05/20/2025, view: 931, Q&A: 0
... 该统计结果提示，在进行蛋白与蛋白互作亲和力检测时，HBS-EP+可以作为实验所需运行缓冲液的首选；而针对蛋白与小分子的互作特征研究而言，两种缓冲液都可考虑作为运行缓冲液。 SPR技术研究蛋白与小分子互作的特性（图3）。 在33例采用单循环动力学模式的研究对象中，四分之三为针对抗原抗体亲和力表征，5例为受体与蛋白亲和力表征，3例为蛋白与小分子互作
动物微生物单细胞转录组分析工具：现状与未来发展方向
Authors:  赵李頔涵房楠楠, 王恺毅, 王海燕, 闫利平, 高云云 and date: 11/25/2025, view: 257, Q&A: 0
... 下游分析包括聚类、批次效应矫正、功能簇识别、细胞互作、伪时间轨迹和功能富集。 微生物单细胞互作分析依赖于功能注释和物种标注的精确性。例如 MscT 使用SPIEC-EASI构建稀疏逆协方差网络，识别生态关联，并通过Gephi可视化 细胞单位间的交互。 ，结合SortMeRNAv4.3.4 [93]、STAR、featureCounts、UMI-tools构建矩阵，Seurat v4进行聚类，最终用blastnv2.12.0[94] 预测宿主-噬菌体互作 高质量基因矩阵导入Seur