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利用SPR技术研究蛋白与小分子化合物相互作用的方法和解决方案
Strategy and Solution for the Studying of Protein-small Molecule Interaction by SPR Technology
Authors:  曹忠莲杨萍 and date: 02/13/2025, view: 1739, Q&A: 0
在做蛋白与分子相互作用分析时,如何解决化合物溶解性低、而与靶蛋白亲和力又弱的问题? 在进行蛋白与分子相互作用分析时,会遇到化合物溶解性低且与靶蛋白亲和力又弱的情况。 分子化合物作为分析物时参比通道通有非特异性吸附,如何解决? 蛋白与分子化合物拟合时,为什么有的用kinetics拟合,有的用Affinity拟合? 分子化合物
基于表面等离子共振技术垂钓方法发现中草药活性成分
Discovery of Active Ingredients in Chinese Herbal Medicine Based on the Fishing Method of Surface Plasmon Resonance Technology
Author:  王静date: 05/17/2024, view: 1448, Q&A: 0
... 在本实验案例中,由于垂钓出的分子化合物只有16种,数量不太多,因此直接通过Biacore仪器检测这16个分子化合物与靶蛋白的亲和力来对垂钓出的分子化合物进行验证。 中药活性分子化合物母液 用1× PBS-P溶解中药活性分子化合物至10 mM。致谢感谢北京大学药学院天然药物及仿生药物全国重点实验室提供仪器技术支撑
应用SPR技术验证结合NSP10的小分子
Biophysical Evaluation of Small Molecules Potentially Targeting NSP10 by Surface Plasmon Resonance
Authors:  李云齐陈彦文, 谭云 and date: 11/15/2023, view: 1258, Q&A: 0
图7 化合物43 多浓度梯度的信号拟合图 实验注意要点用SPR筛选分子药物时,由于大多数情况下分子化合物在运行缓冲溶液中的溶解性有限,因此一般多需要加入一定比例的DMSO助溶。 四、分子化合物亲和力测定 根据单浓度高通量筛选结果的响应情况,去除阴性结果的化合物,剩下化合物按响应值大小排序。优先测试响应值较高的化合物。 推荐实验前用制备运行缓冲溶液的DMSO样品溶解
荧光偏振技术在β-catenin/LEF1相互作用小分子抑制剂高通量筛选中的应用
Application of A Fluorescence Polarization Screening Assay for the Discovery of β-catenin/LEF1 Interaction Antagonists
Authors:  闫干干戚海燕, 付正豪, 陈云雨 and date: 06/24/2021, view: 3906, Q&A: 0
如果分子化合物为非活性化合物,那么分子量较大的β-catenin将与分子量较小的FITC-LEF1发生特异性结合反应,荧光复合物的分子量将增大,旋转速度较慢,荧光偏振实验中表现较高的毫偏值 (millipolarization 按照下述公式计算苗头化合物 (Hit) 的抑制率,其中μHit为苗头化合物mP值的平均值。苗头化合物的初判标准:抑制率 > 50%的分子化合物
利用SPR技术高通量筛选蛋白互作活性小分子
High-Throughput Screening for Small Molecules Interacting with Targeted Protein by SPR Technology
Authors:  刘伟谢华彬, 王烁英, 慈云青, 许超, 兰姝珏, 陈铭 and date: 03/06/2025, view: 1860, Q&A: 0
以筛选靶标蛋白互作分子化合物为例,图1展示了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心化学生物学技术平台创建的利用Biacore 8K仪器发现与靶标蛋白互作分子化合物的高通量筛选完整流程。 图1 利用SPR技术发现与靶标蛋白互作分子化合物的高通量筛选流程图 通过蛋白稳定性评估来确定SPR高通量筛选时合适的条件。例如:实验运行缓冲液类型;实验温度;实验总时长;待筛选分子化合物
酶联免疫吸附实验在β-catenin/TCF4相互作用小分子抑制剂高通量筛选中的应用
Application of An Enzyme-linked Immunosorbent Assay for the Screening of Small-molecule Inhibitors Targeting β-catenin/TCF4 Interaction
Authors:  付正豪戚海燕, 闫干干, 刘晓平, 陈云雨 and date: 07/07/2021, view: 1814, Q&A: 0
在初次筛选中,判定抑制率大于50%的分子化合物为候选苗头化合物。 ELISA筛选模型Z′因子值的确定分子化合物的高通量筛选 应用上述ELISA筛选模型对本室天然产物化合物库 (含500个天然产物) 进行第一轮筛选,以初筛抑制率大于50%为标准,共获得10个候选苗头化合物 PBST洗板3次后,将0.5 μg/ml β-catenin以99 μl/孔加入到包被GST-TCF4 βBD (2 μg/ml) 的96孔酶标板中,再以1 μl
高通量筛选乙酰转移酶活性抑制剂
High-throughput Screening of Acetyltransferase Inhibitors
Authors:  杨文思陈晓慧, 张林, 兰姝珏 and date: 11/12/2021, view: 2843, Q&A: 0
... 本次实验目的是要筛选可以和靶蛋白结合的分子化合物,该类实验宜将靶蛋白作为配体,将待筛选的分子化合物作为分析物。这种情况下,所需的配体偶联量通常较高,应优先选择氨基偶联的方式来固定配体。 酶蛋白与化合物的亲和力测定 经过单浓度筛选,确定了与酶蛋白有结合的分子化合物。接下来进行化合物与酶蛋白亲和力测定。在本次实验中,我们对化合物进行了系列浓度梯度稀释。 测定酶蛋白与
报告基因系统高通量筛选酶蛋白的小分子抑制剂
High-throughput Screening Small Molecule Inhibitors of Enzyme by Reporter Gene System
Authors:  陈晓慧邹怡然, 兰姝珏, 王海波 and date: 11/12/2021, view: 2853, Q&A: 0
分子化合物抑制羟化酶后,Notch蛋白被切割产生活化转录因子的效率下降,由该转录因子驱动的GFP报告基因表达则同时减弱;当分子化合物对羟化酶无抑制作用时,Notch蛋白可以在蛋白酶的帮助下顺利产生大量活性转录因子 ,并利用Incucyte仪器长时间记录细胞中GFP荧光强度变化,以获取Notch信号通路驱动的GFP表达情况,间接反应分子化合物对羟化酶介导的Notch信号通路活化的抑制效果,筛选有效Hits。 model numb